44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5090 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5090  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  243  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0267211 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4026  hypothetical protein  96.58 
 
 		 117 aa  237  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.686403 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3695  protein of unknown function DUF1044  70.69 
 
 		 119 aa  176  7e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.477088  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3985  putative cytoplasmic protein  67.52 
 
 		 134 aa  167  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4003  putative cytoplasmic protein  67.52 
 
 		 119 aa  166  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4057  putative cytoplasmic protein  67.52 
 
 		 119 aa  166  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.197527  normal  0.223407 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4108  hypothetical protein  67.24 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4173  hypothetical protein  67.24 
 
 		 134 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.723164  normal  0.992967 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1781  protein of unknown function DUF1044  52.25 
 
 		 133 aa  120  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.245203 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1502  hypothetical protein  52.25 
 
 		 133 aa  120  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6332  hypothetical protein  45.54 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0124  hypothetical protein  42.98 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3003  hypothetical protein  43.75 
 
 		 121 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2983  hypothetical protein  44.64 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2369  hypothetical protein  44.64 
 
 		 121 aa  103  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1496  hypothetical protein  55.95 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.244659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3030  hypothetical protein  41.96 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2893  hypothetical protein  42.86 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1535  hypothetical protein  36.44 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.823036 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1844  protein of unknown function DUF1044  33.9 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4707  hypothetical protein  36.13 
 
 		 123 aa  72  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0165  protein of unknown function DUF1044  32.79 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3429  hypothetical protein  39.67 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012204 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1817  hypothetical protein  33.64 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000610999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0057  hypothetical protein  30.25 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000330788  n/a   
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0025  hypothetical protein  29.41 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.292513  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3645  hypothetical protein  30.08 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.801747  hitchhiker  0.0000000000510649 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0793  hypothetical protein  31.97 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0762  hypothetical protein  35.29 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1812  hypothetical protein  36.47 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1245  hypothetical protein  28.23 
 
 		 127 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4308  hypothetical protein  36.43 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00337964  normal  0.132689 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4183  hypothetical protein  36.73 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2545  protein of unknown function DUF1044  29.06 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2182  protein of unknown function DUF1044  29.66 
 
 		 124 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.455247  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2626  hypothetical protein  27.97 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1231  hypothetical protein  30.56 
 
 		 128 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1618  hypothetical protein  27.27 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00073  hypothetical protein  28.07 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0470  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0639  protein of unknown function DUF1044  27.78 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12836  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0155  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.77632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0922  hypothetical protein  27.12 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0400088  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2086  hypothetical protein  30.93 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.984543  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>