36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2678 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2678  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  226  9e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.116837  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4707  hypothetical protein  49.35 
 
 
123 aa  82.8  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0793  hypothetical protein  48.68 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00073  hypothetical protein  40.79 
 
 
116 aa  65.5  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1812  hypothetical protein  36.62 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0762  hypothetical protein  37.78 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3645  hypothetical protein  40.26 
 
 
125 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.801747  hitchhiker  0.0000000000510649 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3429  hypothetical protein  37.18 
 
 
129 aa  56.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012204 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1817  hypothetical protein  41.54 
 
 
172 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000610999  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6332  hypothetical protein  45.31 
 
 
121 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0025  hypothetical protein  35.9 
 
 
121 aa  53.5  0.0000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.292513  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0057  hypothetical protein  35.9 
 
 
121 aa  53.5  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000330788  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0639  protein of unknown function DUF1044  37.5 
 
 
129 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12836  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2086  hypothetical protein  36.84 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.984543  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0165  protein of unknown function DUF1044  32.47 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.322066  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0922  hypothetical protein  36.36 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0400088  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0053a  hypothetical protein  38.46 
 
 
83 aa  52  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0293608  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1245  hypothetical protein  35.06 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2626  hypothetical protein  35.53 
 
 
127 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2369  hypothetical protein  40.62 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2983  hypothetical protein  40.62 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2893  hypothetical protein  44 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3030  hypothetical protein  44.9 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1844  protein of unknown function DUF1044  31.25 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1618  hypothetical protein  31.65 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1231  hypothetical protein  37.5 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3003  hypothetical protein  39.06 
 
 
121 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2182  protein of unknown function DUF1044  37.1 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.455247  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0851  hypothetical protein  30.77 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.152374  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4311  protein of unknown function DUF1044  39.06 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0427223  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4183  hypothetical protein  32.1 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1535  hypothetical protein  31.58 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.823036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0155  hypothetical protein  44.16 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.77632  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4308  hypothetical protein  31.31 
 
 
132 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00337964  normal  0.132689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0470  hypothetical protein  34.15 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542672  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0124  hypothetical protein  34.92 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>