17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21690 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21690  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  295  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00102012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0656  hypothetical protein  44.93 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.449417  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21680  hypothetical protein  45.9 
 
 		 147 aa  120  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00327454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4901  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 267 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4426  helix-turn-helix domain-containing protein  42.11 
 
 		 273 aa  44.7  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7796  putative transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 271 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4643  XRE family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 315 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1716  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 273 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3757  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 273 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.559564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2212  XRE family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 285 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2438  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 306 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1438  transcriptional regulator, XRE family  26.37 
 
 		 284 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.161381  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2276  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 271 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4350  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 264 aa  40.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2786  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 271 aa  40.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.842285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2769  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 272 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2725  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 272 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.692599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>