19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13180 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_13180  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  462  1e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.731417 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0375  hypothetical protein  65.8 
 
 
231 aa  322  3e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2306  hypothetical protein  54.94 
 
 
232 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000512455  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03570  hypothetical protein  51.95 
 
 
231 aa  236  3e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.705996  normal  0.134532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0730  hypothetical protein  37.84 
 
 
227 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.124883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0241  hypothetical protein  36.28 
 
 
224 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0225517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4919  hypothetical protein  29.81 
 
 
225 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1816  hypothetical protein  29.65 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1596  tubulin/FtsZ, GTPase  23.35 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00646498 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3170  hypothetical protein  22.05 
 
 
229 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0702  hypothetical protein  24.36 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1554  hypothetical protein  24.39 
 
 
225 aa  57  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0826077  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1406  hypothetical protein  29.13 
 
 
228 aa  55.1  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0250  hypothetical protein  23.15 
 
 
223 aa  54.3  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2179  hypothetical protein  28.68 
 
 
230 aa  53.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.419908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1305  hypothetical protein  23.96 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.513328  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07661  hypothetical protein  24.46 
 
 
229 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.411925  hitchhiker  0.00185927 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1142  hypothetical protein  28.06 
 
 
229 aa  45.8  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0728659  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5613  hypothetical protein  23.91 
 
 
226 aa  45.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716122  normal  0.161209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>