23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1142 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1142  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  449  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0728659  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1406  hypothetical protein  67.25 
 
 		 228 aa  315  5e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0250  hypothetical protein  69.06 
 
 		 223 aa  308  4e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2179  hypothetical protein  67.26 
 
 		 230 aa  300  2e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.419908  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1596  tubulin/FtsZ, GTPase  60.27 
 
 		 225 aa  282  3.0000000000000004e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00646498 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0702  hypothetical protein  56.16 
 
 		 222 aa  260  1e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1305  hypothetical protein  55.09 
 
 		 221 aa  247  8e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.513328  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1554  hypothetical protein  34.03 
 
 		 225 aa  103  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0826077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4919  hypothetical protein  39.68 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0730  hypothetical protein  30.41 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.124883  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1816  hypothetical protein  34.15 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3170  hypothetical protein  27.18 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07661  hypothetical protein  32.43 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.411925  hitchhiker  0.00185927 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0241  hypothetical protein  30.68 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0225517  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13180  hypothetical protein  28.06 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.731417 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3374  hypothetical protein  32.5 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0121644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0375  hypothetical protein  27.68 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5613  hypothetical protein  27.49 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716122  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03570  hypothetical protein  32.18 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.705996  normal  0.134532 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2306  hypothetical protein  29 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000512455  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3312  hypothetical protein  40.91 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0872079  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3456  hypothetical protein  27.27 
 
 		 173 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0470029  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3392  hypothetical protein  27.27 
 
 		 173 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>