21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0241 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0241  hypothetical protein  100 
 
 
224 aa  444  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0225517  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0730  hypothetical protein  55.2 
 
 
227 aa  248  5e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.124883  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13180  hypothetical protein  36.28 
 
 
231 aa  149  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.731417 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0375  hypothetical protein  37.93 
 
 
231 aa  142  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2306  hypothetical protein  37.05 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000512455  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03570  hypothetical protein  34.74 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.705996  normal  0.134532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1816  hypothetical protein  27.75 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4919  hypothetical protein  28.43 
 
 
225 aa  98.6  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1406  hypothetical protein  30.54 
 
 
228 aa  78.6  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1554  hypothetical protein  30.12 
 
 
225 aa  78.2  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0826077  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1596  tubulin/FtsZ, GTPase  34.48 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00646498 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0250  hypothetical protein  29.9 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2179  hypothetical protein  33.1 
 
 
230 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.419908  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3170  hypothetical protein  23.25 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1142  hypothetical protein  30.86 
 
 
229 aa  63.2  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0728659  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0702  hypothetical protein  23.98 
 
 
222 aa  62  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1305  hypothetical protein  29.23 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.513328  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3392  hypothetical protein  35.14 
 
 
173 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3456  hypothetical protein  35.14 
 
 
173 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0470029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3312  hypothetical protein  35.05 
 
 
176 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0872079  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5613  hypothetical protein  24.22 
 
 
226 aa  45.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716122  normal  0.161209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>