23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1554 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1554  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  455  1e-127  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0826077  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1596  tubulin/FtsZ, GTPase  33.85 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00646498 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1406  hypothetical protein  40.94 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0250  hypothetical protein  33.5 
 
 
223 aa  106  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0702  hypothetical protein  30.32 
 
 
222 aa  105  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2179  hypothetical protein  37.84 
 
 
230 aa  104  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.419908  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1305  hypothetical protein  32.49 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.513328  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1142  hypothetical protein  34.03 
 
 
229 aa  92.4  5e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0728659  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1816  hypothetical protein  38.89 
 
 
228 aa  91.7  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4919  hypothetical protein  37.1 
 
 
225 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0730  hypothetical protein  25.13 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.124883  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3170  hypothetical protein  25 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0241  hypothetical protein  30.12 
 
 
224 aa  78.2  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0225517  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07661  hypothetical protein  28.83 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.411925  hitchhiker  0.00185927 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5613  hypothetical protein  30.67 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0716122  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2306  hypothetical protein  27.62 
 
 
232 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000512455  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0375  hypothetical protein  25.85 
 
 
231 aa  58.9  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3374  hypothetical protein  30.6 
 
 
176 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0121644  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13180  hypothetical protein  24.39 
 
 
231 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.731417 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3392  hypothetical protein  39.47 
 
 
173 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3456  hypothetical protein  39.47 
 
 
173 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0470029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3312  hypothetical protein  43.55 
 
 
176 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0872079  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03570  hypothetical protein  28.92 
 
 
231 aa  50.1  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.705996  normal  0.134532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>