16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03570 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_03570  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  467  1.0000000000000001e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.705996  normal  0.134532 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0375  hypothetical protein  59.74 
 
 
231 aa  283  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13180  hypothetical protein  51.95 
 
 
231 aa  249  3e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.731417 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2306  hypothetical protein  52.36 
 
 
232 aa  240  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000512455  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0730  hypothetical protein  41.29 
 
 
227 aa  164  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.124883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0241  hypothetical protein  34.27 
 
 
224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0225517  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4919  hypothetical protein  31.37 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1816  hypothetical protein  29.41 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.485663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1406  hypothetical protein  26.36 
 
 
228 aa  62.4  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3170  hypothetical protein  23.19 
 
 
229 aa  59.3  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2179  hypothetical protein  30.22 
 
 
230 aa  55.5  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.419908  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1596  tubulin/FtsZ, GTPase  28.78 
 
 
225 aa  55.1  0.0000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00646498 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1554  hypothetical protein  30.21 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0826077  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0250  hypothetical protein  28.99 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0702  hypothetical protein  30.09 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1305  hypothetical protein  26.28 
 
 
221 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.513328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>