87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2138 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2138  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  266  8.999999999999999e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1425  hypothetical protein  57.02 
 
 
127 aa  139  9e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1391  DnaJ-like, subfamily C, member 28  50.42 
 
 
132 aa  129  9e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0545891  normal  0.728464 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2043  hypothetical protein  51.26 
 
 
134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0357  hypothetical protein  48.31 
 
 
129 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1180  hypothetical protein  45.38 
 
 
138 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0033  hypothetical protein  44.74 
 
 
126 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0019  hypothetical protein  46.49 
 
 
126 aa  103  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1157  hypothetical protein  48.48 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3588  hypothetical protein  42.86 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.176782  normal  0.0999018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0360  hypothetical protein  41.53 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0363  hypothetical protein  41.53 
 
 
123 aa  94.7  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0386  hypothetical protein  41.53 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0372  hypothetical protein  41.53 
 
 
123 aa  95.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0429  hypothetical protein  41.53 
 
 
123 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2022  hypothetical protein  45.83 
 
 
124 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000128299  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3716  hypothetical protein  42.02 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.382925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3681  hypothetical protein  42.02 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3779  hypothetical protein  42.02 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.496691  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3609  hypothetical protein  42.02 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.377178 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3608  hypothetical protein  42.02 
 
 
122 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0444844  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0420  conserved hypothetical protein  42.02 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.698705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03095  hypothetical protein  42.02 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3487  hypothetical protein  42.02 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0132445  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03144  hypothetical protein  42.02 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0420  hypothetical protein  42.02 
 
 
122 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0418583  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3679  hypothetical protein  42.02 
 
 
122 aa  92  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0498  hypothetical protein  41.03 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4615  hypothetical protein  41.18 
 
 
122 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00242276  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0367  hypothetical protein  41.03 
 
 
123 aa  90.5  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3776  hypothetical protein  41.18 
 
 
122 aa  90.5  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0228231  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0531  hypothetical protein  51.32 
 
 
137 aa  90.1  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0451  hypothetical protein  55.26 
 
 
123 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0758288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0499  hypothetical protein  53.95 
 
 
123 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4873  hypothetical protein  55.26 
 
 
123 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1281  DnaJ-like, subfamily C, member 28, conserved domain protein  57.65 
 
 
123 aa  89.4  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0374  hypothetical protein  39.83 
 
 
123 aa  88.6  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0621  hypothetical protein  37.93 
 
 
123 aa  87.8  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0398  hypothetical protein  56.34 
 
 
124 aa  86.7  9e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1375  hypothetical protein  38.52 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0308072  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2335  hypothetical protein  35.29 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.688143 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1919  hypothetical protein  34.45 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889202  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3794  hypothetical protein  44.12 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0176  hypothetical protein  38.66 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1306  hypothetical protein  32.77 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.815416  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1957  hypothetical protein  33.05 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2061  hypothetical protein  33.05 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1884  hypothetical protein  33.05 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377448  normal  0.627618 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1301  hypothetical protein  33.05 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0801556 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6108  hypothetical protein  32.2 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5284  hypothetical protein  32.2 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1969  hypothetical protein  32.2 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1993  hypothetical protein  32.2 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3795  hypothetical protein  52.38 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2030  hypothetical protein  42.71 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000204387  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2395  hypothetical protein  32.2 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3296  hypothetical protein  32.2 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.555154  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2539  hypothetical protein  31.93 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2438  hypothetical protein  32.2 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195653  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1286  hypothetical protein  32.2 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294721  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1515  hypothetical protein  32.2 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2014  hypothetical protein  32.2 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3161  hypothetical protein  38.83 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.581072  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0350  hypothetical protein  50.77 
 
 
129 aa  66.6  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0979  hypothetical protein  41.67 
 
 
183 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3001  hypothetical protein  34.83 
 
 
187 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2100  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2450  hypothetical protein  39.77 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.324613  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2182  hypothetical protein  35.71 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1416  hypothetical protein  45 
 
 
189 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0167  hypothetical protein  39.51 
 
 
166 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2469  hypothetical protein  38.64 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2708  hypothetical protein  38.64 
 
 
541 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000932167 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2435  esterase  38.64 
 
 
541 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2508  hypothetical protein  38.64 
 
 
164 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000891138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2693  hypothetical protein  38.64 
 
 
135 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.395316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2712  hypothetical protein  37.5 
 
 
287 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2597  hypothetical protein  36.36 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000533442 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1988  hypothetical protein  30.93 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.480942  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2389  DnaJ-like protein  48.21 
 
 
128 aa  50.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.311805  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1645  hypothetical protein  35.48 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54562  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0698  hypothetical protein  29.9 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06200  protein of unknown function (DUF1992)  38.36 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3668  hypothetical protein  31.45 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2069  hypothetical protein  34.78 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1984  hypothetical protein  34.78 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0260161  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1975  hypothetical protein  25.51 
 
 
110 aa  41.2  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.152581 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>