80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0420 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_0420  conserved hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  245  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.698705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03095  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  245  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0420  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  245  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0418583  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03144  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  245  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3487  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  245  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0132445  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3679  hypothetical protein  99.18 
 
 
122 aa  244  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3776  hypothetical protein  99.18 
 
 
122 aa  243  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0228231  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4615  hypothetical protein  99.18 
 
 
122 aa  243  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00242276  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3588  hypothetical protein  95.9 
 
 
122 aa  236  9e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.176782  normal  0.0999018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3681  hypothetical protein  86.07 
 
 
122 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3716  hypothetical protein  86.07 
 
 
122 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.382925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3609  hypothetical protein  86.07 
 
 
122 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.377178 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3608  hypothetical protein  86.07 
 
 
122 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0444844  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3779  hypothetical protein  86.07 
 
 
122 aa  211  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.496691  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3795  hypothetical protein  55.46 
 
 
119 aa  142  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0350  hypothetical protein  49.58 
 
 
129 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2138  hypothetical protein  42.02 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1157  hypothetical protein  49.51 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1425  hypothetical protein  47.78 
 
 
127 aa  87.8  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2043  hypothetical protein  47.96 
 
 
134 aa  87.8  5e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0531  hypothetical protein  51.9 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2022  hypothetical protein  59.42 
 
 
124 aa  83.6  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000128299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0357  hypothetical protein  40.98 
 
 
129 aa  82  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1180  hypothetical protein  41.23 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0621  hypothetical protein  48.15 
 
 
123 aa  78.2  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0176  hypothetical protein  49.35 
 
 
124 aa  77  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1391  DnaJ-like, subfamily C, member 28  37.76 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0545891  normal  0.728464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2335  hypothetical protein  42.34 
 
 
133 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.688143 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0033  hypothetical protein  40.22 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5284  hypothetical protein  36.92 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1969  hypothetical protein  36.92 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1993  hypothetical protein  36.92 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1301  hypothetical protein  51.32 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0801556 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6108  hypothetical protein  36.92 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1306  hypothetical protein  56.25 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.815416  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1884  hypothetical protein  36.92 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377448  normal  0.627618 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1957  hypothetical protein  36.92 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1281  DnaJ-like, subfamily C, member 28, conserved domain protein  41.03 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1919  hypothetical protein  36.15 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889202  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0360  hypothetical protein  37.63 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0372  hypothetical protein  37.63 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0386  hypothetical protein  37.63 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0363  hypothetical protein  37.63 
 
 
123 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0429  hypothetical protein  36.56 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0367  hypothetical protein  37.63 
 
 
123 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3794  hypothetical protein  42.55 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2061  hypothetical protein  48.68 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0019  hypothetical protein  35.48 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1375  hypothetical protein  47.3 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0308072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4873  hypothetical protein  46.97 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0398  hypothetical protein  50.75 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0498  hypothetical protein  36.56 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0499  hypothetical protein  45.45 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0451  hypothetical protein  46.97 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0758288  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1286  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294721  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2438  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195653  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2395  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3296  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.555154  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2014  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1515  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2539  hypothetical protein  50 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0374  hypothetical protein  35.87 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3001  hypothetical protein  52.63 
 
 
187 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2100  hypothetical protein  54.39 
 
 
187 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0167  hypothetical protein  44.44 
 
 
166 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1416  hypothetical protein  44 
 
 
189 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3161  hypothetical protein  40 
 
 
107 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.581072  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2030  hypothetical protein  33.33 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000204387  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1988  hypothetical protein  33.62 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.480942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0979  hypothetical protein  45.65 
 
 
183 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2450  hypothetical protein  46.03 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.324613  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2435  esterase  44.44 
 
 
541 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2708  hypothetical protein  44.44 
 
 
541 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000932167 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2508  hypothetical protein  44.44 
 
 
164 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000891138  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2469  hypothetical protein  44.44 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163678  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0698  hypothetical protein  32.76 
 
 
114 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2693  hypothetical protein  44.44 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.395316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2712  hypothetical protein  42.86 
 
 
287 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2597  hypothetical protein  42.86 
 
 
135 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000533442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2182  hypothetical protein  40.28 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>