42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2389 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2389  DnaJ-like protein  100 
 
 
128 aa  255  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.311805  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05050  protein of unknown function (DUF1992)  55.08 
 
 
200 aa  121  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06200  protein of unknown function (DUF1992)  43.2 
 
 
162 aa  95.9  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1645  hypothetical protein  43.2 
 
 
128 aa  93.2  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54562  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3668  hypothetical protein  43.9 
 
 
156 aa  87  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0960  hypothetical protein  45.45 
 
 
159 aa  82.8  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0614647  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3249  hypothetical protein  41.94 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2182  hypothetical protein  37.8 
 
 
133 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4391  hypothetical protein  40.35 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.579425  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3536  hypothetical protein  40.34 
 
 
201 aa  73.9  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1984  hypothetical protein  38.14 
 
 
140 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0260161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2069  hypothetical protein  39.13 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1965  hypothetical protein  40 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.390139  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0120  DnaJ-like, subfamily C, member 28, conserved domain protein  32.8 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.187684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4761  hypothetical protein  33.06 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2138  hypothetical protein  48.21 
 
 
131 aa  50.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2708  hypothetical protein  29.17 
 
 
541 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000932167 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2450  hypothetical protein  30.93 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.324613  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2435  esterase  29.17 
 
 
541 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2712  hypothetical protein  29.17 
 
 
287 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2469  hypothetical protein  29.17 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2597  hypothetical protein  29 
 
 
135 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000533442 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1425  hypothetical protein  42.86 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2693  hypothetical protein  29.9 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.395316  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1157  hypothetical protein  36.84 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2508  hypothetical protein  29.17 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000891138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0621  hypothetical protein  43.28 
 
 
123 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0372  hypothetical protein  39.66 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0363  hypothetical protein  39.66 
 
 
123 aa  42.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0360  hypothetical protein  39.66 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0386  hypothetical protein  39.66 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1180  hypothetical protein  36.7 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0429  hypothetical protein  39.66 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1919  hypothetical protein  39.68 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889202  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2043  hypothetical protein  30.25 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2335  hypothetical protein  39.68 
 
 
133 aa  42  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.688143 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0033  hypothetical protein  36.73 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0499  hypothetical protein  37.93 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0498  hypothetical protein  37.93 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0367  hypothetical protein  37.93 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0451  hypothetical protein  39.66 
 
 
123 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0758288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0357  hypothetical protein  42.86 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>