22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_05050 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_05050  protein of unknown function (DUF1992)  100 
 
 
200 aa  398  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2389  DnaJ-like protein  55.08 
 
 
128 aa  121  8e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.311805  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4391  hypothetical protein  44.04 
 
 
188 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.579425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3249  hypothetical protein  44.26 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06200  protein of unknown function (DUF1992)  48.39 
 
 
162 aa  80.1  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3536  hypothetical protein  42.86 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1984  hypothetical protein  39.02 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0260161  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2182  hypothetical protein  37.69 
 
 
133 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2069  hypothetical protein  38.71 
 
 
140 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1965  hypothetical protein  40.32 
 
 
141 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.390139  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3668  hypothetical protein  36.36 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0960  hypothetical protein  40.87 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0614647  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1645  hypothetical protein  36.29 
 
 
128 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54562  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4761  hypothetical protein  39.37 
 
 
136 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0120  DnaJ-like, subfamily C, member 28, conserved domain protein  34.96 
 
 
162 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.187684  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3001  hypothetical protein  78.57 
 
 
187 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1547  hypothetical protein  37.36 
 
 
100 aa  47.4  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0712336  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2100  hypothetical protein  64.52 
 
 
187 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0033  hypothetical protein  36.54 
 
 
126 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1425  hypothetical protein  65.52 
 
 
127 aa  44.7  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2043  hypothetical protein  56.67 
 
 
134 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0979  hypothetical protein  35.71 
 
 
183 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>