21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06200 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_06200  protein of unknown function (DUF1992)  100 
 
 
162 aa  315  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2389  DnaJ-like protein  43.2 
 
 
128 aa  95.5  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.311805  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05050  protein of unknown function (DUF1992)  48.39 
 
 
200 aa  79.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3249  hypothetical protein  37.58 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4391  hypothetical protein  42.7 
 
 
188 aa  64.7  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.579425  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1645  hypothetical protein  40 
 
 
128 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54562  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2182  hypothetical protein  38.4 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3536  hypothetical protein  39.8 
 
 
201 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0960  hypothetical protein  40.66 
 
 
159 aa  55.1  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0614647  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3668  hypothetical protein  32.21 
 
 
156 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4761  hypothetical protein  32.82 
 
 
136 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1425  hypothetical protein  43.42 
 
 
127 aa  47.8  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1984  hypothetical protein  34.38 
 
 
140 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0260161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2069  hypothetical protein  34.38 
 
 
140 aa  44.3  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0374  hypothetical protein  29.47 
 
 
123 aa  43.9  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2061  hypothetical protein  41.98 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1547  hypothetical protein  36.47 
 
 
100 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0712336  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2138  hypothetical protein  38.36 
 
 
131 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1180  hypothetical protein  38.67 
 
 
138 aa  42  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0621  hypothetical protein  37.18 
 
 
123 aa  40.8  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2335  hypothetical protein  46.43 
 
 
133 aa  40.8  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.688143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>