44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1547 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1547  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0712336  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2061  hypothetical protein  45.74 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2539  hypothetical protein  43.62 
 
 		 168 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2450  hypothetical protein  38.27 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.324613  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2508  hypothetical protein  37.93 
 
 		 164 aa  52  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000891138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2435  esterase  37.04 
 
 		 541 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1515  hypothetical protein  43.62 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2708  hypothetical protein  37.04 
 
 		 541 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000932167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1919  hypothetical protein  43.96 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889202  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1286  hypothetical protein  43.62 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294721  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2438  hypothetical protein  43.62 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195653  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2395  hypothetical protein  43.62 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3296  hypothetical protein  43.62 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.555154  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2014  hypothetical protein  43.62 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2693  hypothetical protein  37.93 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.395316  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2469  hypothetical protein  35.8 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2597  hypothetical protein  35.8 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000533442 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1957  hypothetical protein  40.66 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2335  hypothetical protein  41.76 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.688143 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1301  hypothetical protein  40.66 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0801556 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1884  hypothetical protein  40.66 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377448  normal  0.627618 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2712  hypothetical protein  34.57 
 
 		 287 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1416  hypothetical protein  37.7 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1425  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1969  hypothetical protein  39.56 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6108  hypothetical protein  39.56 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05050  protein of unknown function (DUF1992)  37.36 
 
 		 200 aa  47.4  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5284  hypothetical protein  39.56 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1993  hypothetical protein  39.56 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1375  hypothetical protein  34.74 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0308072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0621  hypothetical protein  38.89 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2043  hypothetical protein  39.47 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0167  hypothetical protein  32.53 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1975  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.152581 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1180  hypothetical protein  38.04 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0698  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1306  hypothetical protein  40.66 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.815416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1988  hypothetical protein  33.33 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.480942  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06200  protein of unknown function (DUF1992)  36.47 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0357  hypothetical protein  33.7 
 
 		 129 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0033  hypothetical protein  36.84 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3795  hypothetical protein  34.38 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2100  hypothetical protein  38.75 
 
 		 187 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1281  DnaJ-like, subfamily C, member 28, conserved domain protein  37.23 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>