32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0698 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0698  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  216  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1988  hypothetical protein  98.25 
 
 
114 aa  211  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.480942  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1975  hypothetical protein  57.28 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.152581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0357  hypothetical protein  33.66 
 
 
129 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2138  hypothetical protein  29.9 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2022  hypothetical protein  27.62 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000128299  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0420  conserved hypothetical protein  32.76 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.698705  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03095  hypothetical protein  32.76 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4615  hypothetical protein  32.76 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00242276  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0420  hypothetical protein  32.76 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0418583  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3776  hypothetical protein  32.76 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0228231  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3487  hypothetical protein  32.76 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0132445  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03144  hypothetical protein  32.76 
 
 
122 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3588  hypothetical protein  31.9 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.176782  normal  0.0999018 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3679  hypothetical protein  32.76 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1547  hypothetical protein  33.33 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0712336  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0621  hypothetical protein  27.06 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3794  hypothetical protein  29.41 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0386  hypothetical protein  27.62 
 
 
123 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0360  hypothetical protein  27.62 
 
 
123 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0363  hypothetical protein  27.62 
 
 
123 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0372  hypothetical protein  27.62 
 
 
123 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3161  hypothetical protein  26.73 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.581072  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0429  hypothetical protein  27.62 
 
 
123 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3779  hypothetical protein  29.41 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.496691  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3608  hypothetical protein  29.41 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0444844  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3609  hypothetical protein  29.41 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.377178 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3716  hypothetical protein  29.41 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.382925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3681  hypothetical protein  29.41 
 
 
122 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0167  hypothetical protein  34.85 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1180  hypothetical protein  31.07 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0374  hypothetical protein  28.3 
 
 
123 aa  40.8  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>