20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2069 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2069  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  267  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1984  hypothetical protein  99.29 
 
 
140 aa  265  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0260161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1965  hypothetical protein  77.95 
 
 
141 aa  176  9e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.390139  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2182  hypothetical protein  44.53 
 
 
133 aa  107  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1645  hypothetical protein  45 
 
 
128 aa  97.4  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54562  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3668  hypothetical protein  43.51 
 
 
156 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05050  protein of unknown function (DUF1992)  39.71 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0960  hypothetical protein  41.94 
 
 
159 aa  81.6  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0614647  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4391  hypothetical protein  36.21 
 
 
188 aa  80.5  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.579425  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3249  hypothetical protein  36.3 
 
 
197 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2389  DnaJ-like protein  39.2 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.311805  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3536  hypothetical protein  35.09 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4761  hypothetical protein  32.79 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0120  DnaJ-like, subfamily C, member 28, conserved domain protein  31.3 
 
 
162 aa  56.2  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.187684  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0033  hypothetical protein  39.56 
 
 
126 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2043  hypothetical protein  33.61 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06200  protein of unknown function (DUF1992)  33.33 
 
 
162 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1391  DnaJ-like, subfamily C, member 28  31.96 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0545891  normal  0.728464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2138  hypothetical protein  29.91 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1375  hypothetical protein  38.36 
 
 
124 aa  41.2  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0308072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>