48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2182 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2182  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  265  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3668  hypothetical protein  39.69 
 
 		 156 aa  97.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1984  hypothetical protein  44.35 
 
 		 140 aa  97.1  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0260161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2069  hypothetical protein  44.83 
 
 		 140 aa  97.1  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1965  hypothetical protein  42.97 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.390139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4391  hypothetical protein  39 
 
 		 188 aa  91.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.579425  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0120  DnaJ-like, subfamily C, member 28, conserved domain protein  38.06 
 
 		 162 aa  88.2  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.187684  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0960  hypothetical protein  40.32 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0614647  decreased coverage  0.00444563 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2389  DnaJ-like protein  37.8 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.311805  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1645  hypothetical protein  35.77 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.54562  normal  0.619548 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05050  protein of unknown function (DUF1992)  37.69 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3249  hypothetical protein  36.75 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3536  hypothetical protein  36.84 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06200  protein of unknown function (DUF1992)  38.4 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2138  hypothetical protein  35.71 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1391  DnaJ-like, subfamily C, member 28  35.24 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0545891  normal  0.728464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1425  hypothetical protein  33.05 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2043  hypothetical protein  36.56 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4761  hypothetical protein  29.37 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3588  hypothetical protein  43.06 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.176782  normal  0.0999018 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1157  hypothetical protein  36.14 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0357  hypothetical protein  31.58 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3779  hypothetical protein  41.43 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.496691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3681  hypothetical protein  41.43 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3716  hypothetical protein  41.43 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.382925 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3609  hypothetical protein  41.43 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.377178 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3608  hypothetical protein  41.43 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0444844  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03095  hypothetical protein  40.28 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4615  hypothetical protein  40.28 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00242276  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0420  conserved hypothetical protein  40.28 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.698705  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03144  hypothetical protein  40.28 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0420  hypothetical protein  40.28 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0418583  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3487  hypothetical protein  40.28 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0132445  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3776  hypothetical protein  40.28 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0228231  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3679  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0033  hypothetical protein  31.11 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1180  hypothetical protein  28.87 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2597  hypothetical protein  29 
 
 		 135 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000533442 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0621  hypothetical protein  57.14 
 
 		 123 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2450  hypothetical protein  27.55 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.324613  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2708  hypothetical protein  26.17 
 
 		 541 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000932167 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2022  hypothetical protein  28.28 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000128299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2435  esterase  26.17 
 
 		 541 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2100  hypothetical protein  54.55 
 
 		 187 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1375  hypothetical protein  31.46 
 
 		 124 aa  40.4  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0308072  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1919  hypothetical protein  34.94 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889202  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2469  hypothetical protein  26 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000163678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2508  hypothetical protein  32.86 
 
 		 164 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000891138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>