72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2429 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2429  phosphate-starvation-inducible E  100 
 
 		 138 aa  271  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.357601  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1453  phosphate-starvation-inducible E  82.84 
 
 		 134 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2678  phosphate-starvation-inducible E  76.87 
 
 		 134 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1664  phosphate-starvation-inducible E  76.87 
 
 		 134 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00845708  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1701  phosphate-starvation-inducible E  76.87 
 
 		 134 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.227884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1679  phosphate-starvation-inducible E  76.87 
 
 		 134 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2588  phosphate-starvation-inducible E  77.61 
 
 		 134 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147474  normal  0.02952 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2496  phosphate-starvation-inducible E  77.61 
 
 		 134 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.794951  normal  0.0438404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2426  phosphate-starvation-inducible E  77.61 
 
 		 134 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160666  normal  0.0424424 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2806  hypothetical protein  77.61 
 
 		 134 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1554  phosphate-starvation-inducible E  76.87 
 
 		 134 aa  196  7e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1771  phosphate-starvation-inducible E  74.02 
 
 		 132 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1483  phosphate-starvation-inducible E  75.19 
 
 		 135 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.213148  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1287  hypothetical protein  78.36 
 
 		 134 aa  191  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.369576  normal  0.0154285 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2323  phosphate-starvation-inducible E  76.74 
 
 		 134 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0428039  normal  0.646848 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2877  phosphate-starvation-inducible E  73.44 
 
 		 134 aa  180  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.183291  hitchhiker  0.000000000937357 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1458  phosphate-starvation-inducible E  62.3 
 
 		 148 aa  137  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0609  phosphate-starvation-inducible E  51.69 
 
 		 149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00644  hypothetical protein  45.08 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2600  hypothetical protein  51.91 
 
 		 141 aa  99.4  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.419221  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001849  hypothetical protein  40.48 
 
 		 141 aa  96.7  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0209  phosphate-starvation-inducible E  40.3 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.515873  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0263  phosphate-starvation-inducible E  53.95 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6412  phosphate-starvation-inducible E  43.9 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397536  normal  0.168082 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7003  phosphate-starvation-inducible protein E  45.37 
 
 		 149 aa  87  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5664  phosphate-starvation-inducible E  45.37 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6427  phosphate-starvation-inducible E  43.4 
 
 		 319 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5416  phosphate-starvation-inducible E  41.74 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370602  normal  0.100084 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1402  phosphate-starvation-inducible E  43.4 
 
 		 311 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6017  phosphate-starvation-inducible E  43.4 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134079  normal  0.333922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4082  phosphate-starvation-inducible E  43.33 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142124  normal  0.346542 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1814  phosphate-starvation-inducible E  31.58 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.603697  normal  0.0742718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4769  phosphate-starvation-inducible E  36.8 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0900  phosphate-starvation-inducible E  33.08 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1049  phosphate-starvation-inducible E  38.39 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196003  normal  0.502464 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6224  hypothetical protein  38.39 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.876255  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0824  phosphate-starvation-inducible E  36.8 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4599  phosphate-starvation-inducible E  34.92 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4473  phosphate-starvation-inducible E  34.13 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.317016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4615  phosphate-starvation-inducible E  34.13 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0727  phosphate-starvation-inducible E  33.63 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0917  phosphate-starvation-inducible E  32.06 
 
 		 166 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1034  phosphate-starvation-inducible E  32.58 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1200  hypothetical protein  31.82 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1887  phosphate-starvation-inducible E  35.09 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.549382  normal  0.718455 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10810  Phosphate-starvation-inducible E (PsiE) protein  32.17 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.301134  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0641  phosphate-starvation-inducible E  30.83 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.252997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3240  phosphate-starvation-inducible E  32.79 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20070  hypothetical protein  35.96 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.764079  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1727  hypothetical protein  35.37 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1198  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  32.65 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0915871  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4537  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  31.63 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2978  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  28.23 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0235  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  30.58 
 
 		 136 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.624276 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1302  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  28.23 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5511  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  31.37 
 
 		 136 aa  42.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03862  hypothetical protein  31.37 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3966  phosphate-starvation-inducible E  31.37 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4493  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  31.37 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0800783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3999  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  31.37 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.511957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4581  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  31.37 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4270  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  31.37 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03902  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  31.37 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4620  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  31.37 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4568  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  31.37 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.745601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4568  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  31.37 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0208216 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4483  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  31.37 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4417  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  31.37 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2710  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  29.59 
 
 		 135 aa  40.4  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.275829  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0375  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  31.43 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602786  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3917  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  31.43 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.587769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0303  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  31.43 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>