71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4082 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4082  phosphate-starvation-inducible E  100 
 
 		 144 aa  288  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142124  normal  0.346542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4769  phosphate-starvation-inducible E  71.43 
 
 		 149 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1887  phosphate-starvation-inducible E  47.71 
 
 		 142 aa  98.6  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.549382  normal  0.718455 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1049  phosphate-starvation-inducible E  48.62 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196003  normal  0.502464 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6224  hypothetical protein  48.62 
 
 		 126 aa  97.4  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.876255  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0609  phosphate-starvation-inducible E  42.98 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7003  phosphate-starvation-inducible protein E  38.24 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6017  phosphate-starvation-inducible E  44.23 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134079  normal  0.333922 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5416  phosphate-starvation-inducible E  38.4 
 
 		 150 aa  84  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370602  normal  0.100084 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1402  phosphate-starvation-inducible E  45 
 
 		 311 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6427  phosphate-starvation-inducible E  45 
 
 		 319 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5664  phosphate-starvation-inducible E  42.48 
 
 		 150 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1453  phosphate-starvation-inducible E  43.7 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152108  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1679  phosphate-starvation-inducible E  43.7 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1664  phosphate-starvation-inducible E  43.7 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00845708  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1701  phosphate-starvation-inducible E  44.55 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.227884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2429  phosphate-starvation-inducible E  43.33 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.357601  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6412  phosphate-starvation-inducible E  42.48 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397536  normal  0.168082 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2678  phosphate-starvation-inducible E  44.55 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1771  phosphate-starvation-inducible E  44.44 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1483  phosphate-starvation-inducible E  45.37 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.213148  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00644  hypothetical protein  38.73 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2877  phosphate-starvation-inducible E  46.36 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.183291  hitchhiker  0.000000000937357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10810  Phosphate-starvation-inducible E (PsiE) protein  33.04 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.301134  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1458  phosphate-starvation-inducible E  49.4 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4599  phosphate-starvation-inducible E  45.12 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2323  phosphate-starvation-inducible E  43.64 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0428039  normal  0.646848 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4615  phosphate-starvation-inducible E  43.9 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4473  phosphate-starvation-inducible E  43.9 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.317016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1287  hypothetical protein  42.73 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.369576  normal  0.0154285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0824  phosphate-starvation-inducible E  37.14 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001849  hypothetical protein  37.32 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0917  phosphate-starvation-inducible E  30.99 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0900  phosphate-starvation-inducible E  44.94 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0727  phosphate-starvation-inducible E  31.36 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1554  phosphate-starvation-inducible E  43.7 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2806  hypothetical protein  43.7 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1200  hypothetical protein  37.89 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2588  phosphate-starvation-inducible E  43.7 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147474  normal  0.02952 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2496  phosphate-starvation-inducible E  43.7 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.794951  normal  0.0438404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2426  phosphate-starvation-inducible E  43.7 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160666  normal  0.0424424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1034  phosphate-starvation-inducible E  40.51 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0209  phosphate-starvation-inducible E  40 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.515873  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1814  phosphate-starvation-inducible E  39.44 
 
 		 158 aa  63.5  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.603697  normal  0.0742718 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3240  phosphate-starvation-inducible E  42.17 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20070  hypothetical protein  29.09 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.764079  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1727  hypothetical protein  30.1 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0263  phosphate-starvation-inducible E  45.98 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2600  hypothetical protein  43.08 
 
 		 141 aa  50.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.419221  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5221  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  32.99 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4908  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  30.93 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5242  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  35.9 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0020  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  30.93 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.38872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5225  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  35.9 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00583254  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5324  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  35.9 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4807  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  35.9 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5191  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  35.9 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4789  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  35.9 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4946  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  35.9 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0375  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  28.57 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2978  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  26.32 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3917  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  28.57 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.587769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0303  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  28.57 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1198  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  27.35 
 
 		 135 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0915871  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1302  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  25.66 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0641  phosphate-starvation-inducible E  26.47 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.252997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0836  hypothetical protein  40.68 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2710  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  28.07 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.275829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4537  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  35.82 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3208  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  27.52 
 
 		 141 aa  40.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0235  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  32.29 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.624276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>