80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1049 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1049  phosphate-starvation-inducible E  100 
 
 
126 aa  240  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196003  normal  0.502464 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6224  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  240  5e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.876255  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1887  phosphate-starvation-inducible E  91.2 
 
 
142 aa  221  3e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.549382  normal  0.718455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4769  phosphate-starvation-inducible E  48.18 
 
 
149 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4082  phosphate-starvation-inducible E  48.62 
 
 
144 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142124  normal  0.346542 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1664  phosphate-starvation-inducible E  39.29 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00845708  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1679  phosphate-starvation-inducible E  39.29 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1701  phosphate-starvation-inducible E  39.29 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.227884  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2678  phosphate-starvation-inducible E  39.29 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1771  phosphate-starvation-inducible E  39.29 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1483  phosphate-starvation-inducible E  37.72 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.213148  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0609  phosphate-starvation-inducible E  37.76 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2429  phosphate-starvation-inducible E  38.39 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.357601  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1453  phosphate-starvation-inducible E  36.94 
 
 
134 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152108  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00644  hypothetical protein  39.62 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1458  phosphate-starvation-inducible E  40.23 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001849  hypothetical protein  39.29 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0209  phosphate-starvation-inducible E  41.18 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.515873  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5664  phosphate-starvation-inducible E  38.78 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5416  phosphate-starvation-inducible E  38.68 
 
 
150 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370602  normal  0.100084 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7003  phosphate-starvation-inducible protein E  38.78 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6412  phosphate-starvation-inducible E  38.78 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397536  normal  0.168082 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1402  phosphate-starvation-inducible E  37.76 
 
 
311 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6017  phosphate-starvation-inducible E  37.76 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134079  normal  0.333922 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6427  phosphate-starvation-inducible E  37.76 
 
 
319 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2877  phosphate-starvation-inducible E  37.5 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.183291  hitchhiker  0.000000000937357 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1200  hypothetical protein  34.62 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1034  phosphate-starvation-inducible E  34.62 
 
 
162 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2323  phosphate-starvation-inducible E  38.39 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0428039  normal  0.646848 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1287  hypothetical protein  40.45 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.369576  normal  0.0154285 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0917  phosphate-starvation-inducible E  32.69 
 
 
166 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1554  phosphate-starvation-inducible E  39.29 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2588  phosphate-starvation-inducible E  38.39 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147474  normal  0.02952 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2806  hypothetical protein  38.39 
 
 
134 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10810  Phosphate-starvation-inducible E (PsiE) protein  35.23 
 
 
166 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.301134  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2496  phosphate-starvation-inducible E  38.39 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.794951  normal  0.0438404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2426  phosphate-starvation-inducible E  38.39 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160666  normal  0.0424424 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1814  phosphate-starvation-inducible E  37.14 
 
 
158 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.603697  normal  0.0742718 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0900  phosphate-starvation-inducible E  32.53 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0727  phosphate-starvation-inducible E  31.48 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4599  phosphate-starvation-inducible E  29.7 
 
 
156 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2600  hypothetical protein  39.66 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.419221  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4473  phosphate-starvation-inducible E  28.71 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.317016  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4615  phosphate-starvation-inducible E  28.71 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0824  phosphate-starvation-inducible E  29.59 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3240  phosphate-starvation-inducible E  29.13 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240832  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20070  hypothetical protein  31.43 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.764079  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0263  phosphate-starvation-inducible E  38.1 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2978  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  41.54 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1727  hypothetical protein  30 
 
 
161 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4537  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  34.88 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4417  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  40.91 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1302  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  41.54 
 
 
135 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4483  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  40.91 
 
 
136 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5221  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  40.74 
 
 
133 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4568  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  40.91 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0208216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4568  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  40.91 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.745601 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4620  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  40.91 
 
 
136 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5225  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  40.74 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00583254  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0020  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  40.74 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.38872 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0235  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  32.41 
 
 
136 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.624276 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5242  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  41.79 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5191  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  41.79 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3966  phosphate-starvation-inducible E  33.33 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03862  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4789  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  41.79 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4493  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  33.33 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0800783  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3999  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  33.33 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.511957 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5324  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  41.79 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4946  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  41.79 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4581  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  33.33 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4270  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  33.33 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4807  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  41.79 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03902  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  33.33 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4908  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  40.3 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5511  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  32.22 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4475  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  39.39 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1198  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  38.81 
 
 
135 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0915871  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2710  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  38.81 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.275829  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0641  phosphate-starvation-inducible E  36.99 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.252997  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>