75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3999 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3966  phosphate-starvation-inducible E  100 
 
 
136 aa  269  7e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03902  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  100 
 
 
136 aa  269  7e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4270  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  100 
 
 
136 aa  269  7e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03862  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  269  7e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4581  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  100 
 
 
136 aa  269  7e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3999  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  100 
 
 
136 aa  269  7e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.511957 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4493  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  100 
 
 
136 aa  269  7e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0800783  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5511  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  98.53 
 
 
136 aa  267  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0235  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  97.79 
 
 
136 aa  265  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.624276 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4537  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  97.06 
 
 
132 aa  224  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4568  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  87.5 
 
 
136 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.745601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4568  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  87.5 
 
 
136 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0208216 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4620  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  87.5 
 
 
136 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4417  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  86.76 
 
 
136 aa  210  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4483  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  86.76 
 
 
136 aa  210  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1302  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  70.99 
 
 
135 aa  190  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2978  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  70.99 
 
 
135 aa  189  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0375  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  65.41 
 
 
135 aa  181  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602786  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3917  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  65.41 
 
 
135 aa  181  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.587769  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0303  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  65.41 
 
 
135 aa  181  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2710  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  67.69 
 
 
135 aa  179  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.275829  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1198  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  67.67 
 
 
135 aa  176  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0915871  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4475  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  69.47 
 
 
135 aa  172  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3208  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  54.33 
 
 
141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5324  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  51.97 
 
 
134 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4807  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  51.97 
 
 
134 aa  149  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4789  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  51.97 
 
 
134 aa  149  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4946  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  51.97 
 
 
134 aa  149  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5191  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  51.97 
 
 
134 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5242  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  51.97 
 
 
147 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0020  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  52.8 
 
 
134 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.38872 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3496  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  56.56 
 
 
140 aa  148  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5221  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  51.18 
 
 
133 aa  148  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5225  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  52 
 
 
134 aa  148  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00583254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4908  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  51.18 
 
 
134 aa  148  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1752  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  55.74 
 
 
140 aa  147  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.104619  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3654  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  49.22 
 
 
135 aa  116  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0690  hypothetical protein  35.51 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000236422  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1534  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  30.95 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000577717  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10810  Phosphate-starvation-inducible E (PsiE) protein  36.62 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.301134  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0727  phosphate-starvation-inducible E  34.41 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4599  phosphate-starvation-inducible E  37.5 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4615  phosphate-starvation-inducible E  37.5 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4473  phosphate-starvation-inducible E  37.5 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.317016  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1549  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  26.8 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000247347  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2678  phosphate-starvation-inducible E  29.7 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1701  phosphate-starvation-inducible E  29.7 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.227884  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0900  phosphate-starvation-inducible E  30.25 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1664  phosphate-starvation-inducible E  30.61 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00845708  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1679  phosphate-starvation-inducible E  30.61 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1771  phosphate-starvation-inducible E  30.43 
 
 
132 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2429  phosphate-starvation-inducible E  31.4 
 
 
138 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.357601  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0170  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  29.58 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.213754  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0917  phosphate-starvation-inducible E  36.11 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1034  phosphate-starvation-inducible E  37.5 
 
 
162 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1200  hypothetical protein  37.93 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1287  hypothetical protein  30.69 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.369576  normal  0.0154285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3240  phosphate-starvation-inducible E  34.92 
 
 
164 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240832  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6224  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.876255  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1049  phosphate-starvation-inducible E  33.33 
 
 
126 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196003  normal  0.502464 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2806  hypothetical protein  32.63 
 
 
134 aa  43.5  0.0009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1453  phosphate-starvation-inducible E  31.82 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152108  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2426  phosphate-starvation-inducible E  32.63 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160666  normal  0.0424424 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2588  phosphate-starvation-inducible E  32.63 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147474  normal  0.02952 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1483  phosphate-starvation-inducible E  30.93 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.213148  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2496  phosphate-starvation-inducible E  32.63 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.794951  normal  0.0438404 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1887  phosphate-starvation-inducible E  40.32 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.549382  normal  0.718455 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0824  phosphate-starvation-inducible E  36.67 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1554  phosphate-starvation-inducible E  30.53 
 
 
134 aa  41.2  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1814  phosphate-starvation-inducible E  30.34 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.603697  normal  0.0742718 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20070  hypothetical protein  29.03 
 
 
161 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.764079  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1727  hypothetical protein  32.14 
 
 
161 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4082  phosphate-starvation-inducible E  26.19 
 
 
144 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142124  normal  0.346542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4769  phosphate-starvation-inducible E  39.39 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2877  phosphate-starvation-inducible E  27.07 
 
 
134 aa  40  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.183291  hitchhiker  0.000000000937357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>