67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2806 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2806  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  267  4e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2496  phosphate-starvation-inducible E  99.25 
 
 		 134 aa  265  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.794951  normal  0.0438404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2426  phosphate-starvation-inducible E  99.25 
 
 		 134 aa  265  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160666  normal  0.0424424 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2588  phosphate-starvation-inducible E  99.25 
 
 		 134 aa  265  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147474  normal  0.02952 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1701  phosphate-starvation-inducible E  88.81 
 
 		 134 aa  241  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.227884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2678  phosphate-starvation-inducible E  88.81 
 
 		 134 aa  241  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1664  phosphate-starvation-inducible E  88.06 
 
 		 134 aa  239  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00845708  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1679  phosphate-starvation-inducible E  88.06 
 
 		 134 aa  239  1e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1554  phosphate-starvation-inducible E  97.01 
 
 		 134 aa  238  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1483  phosphate-starvation-inducible E  83.21 
 
 		 135 aa  221  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.213148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1771  phosphate-starvation-inducible E  83.59 
 
 		 132 aa  219  8e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1287  hypothetical protein  85.07 
 
 		 134 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.369576  normal  0.0154285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2429  phosphate-starvation-inducible E  77.61 
 
 		 138 aa  214  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.357601  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1453  phosphate-starvation-inducible E  76.12 
 
 		 134 aa  204  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152108  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2877  phosphate-starvation-inducible E  83.85 
 
 		 134 aa  204  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.183291  hitchhiker  0.000000000937357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2323  phosphate-starvation-inducible E  81.4 
 
 		 134 aa  196  7e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0428039  normal  0.646848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1458  phosphate-starvation-inducible E  60.66 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0609  phosphate-starvation-inducible E  48.41 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00644  hypothetical protein  47.93 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001849  hypothetical protein  45.6 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2600  hypothetical protein  53.33 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.419221  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0263  phosphate-starvation-inducible E  53.33 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0209  phosphate-starvation-inducible E  43.75 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.515873  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7003  phosphate-starvation-inducible protein E  42.98 
 
 		 149 aa  88.6  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5664  phosphate-starvation-inducible E  42.98 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6412  phosphate-starvation-inducible E  42.98 
 
 		 150 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397536  normal  0.168082 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6427  phosphate-starvation-inducible E  42.15 
 
 		 319 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1402  phosphate-starvation-inducible E  42.15 
 
 		 311 aa  87  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6017  phosphate-starvation-inducible E  42.15 
 
 		 150 aa  87.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134079  normal  0.333922 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5416  phosphate-starvation-inducible E  40 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370602  normal  0.100084 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1814  phosphate-starvation-inducible E  35.54 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.603697  normal  0.0742718 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4082  phosphate-starvation-inducible E  43.7 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142124  normal  0.346542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4769  phosphate-starvation-inducible E  40.48 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6224  hypothetical protein  38.39 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.876255  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1049  phosphate-starvation-inducible E  38.39 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196003  normal  0.502464 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0900  phosphate-starvation-inducible E  34.78 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0641  phosphate-starvation-inducible E  32.06 
 
 		 165 aa  67  0.00000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.252997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1887  phosphate-starvation-inducible E  37.84 
 
 		 142 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.549382  normal  0.718455 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0824  phosphate-starvation-inducible E  36.13 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4599  phosphate-starvation-inducible E  34.75 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4473  phosphate-starvation-inducible E  33.9 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.317016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4615  phosphate-starvation-inducible E  33.9 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0917  phosphate-starvation-inducible E  33.61 
 
 		 166 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0727  phosphate-starvation-inducible E  34.82 
 
 		 152 aa  62  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1200  hypothetical protein  40.45 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1034  phosphate-starvation-inducible E  40.45 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3240  phosphate-starvation-inducible E  33.62 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10810  Phosphate-starvation-inducible E (PsiE) protein  36.17 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.301134  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20070  hypothetical protein  37.8 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.764079  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1727  hypothetical protein  36.59 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1198  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  31.2 
 
 		 135 aa  50.4  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0915871  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2978  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  26.98 
 
 		 135 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0303  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  29.69 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4537  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  34.72 
 
 		 132 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3917  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  29.69 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.587769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0375  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  29.69 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602786  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0235  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  32.63 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.624276 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2710  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  29.29 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.275829  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1302  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  26.98 
 
 		 135 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5511  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  31.37 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3966  phosphate-starvation-inducible E  34.21 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03862  hypothetical protein  34.21 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4581  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  34.21 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03902  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  34.21 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3999  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  34.21 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.511957 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4493  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  34.21 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0800783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4270  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  34.21 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>