50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1402 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6427  phosphate-starvation-inducible E  99.68 
 
 
319 aa  607  1e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1402  phosphate-starvation-inducible E  100 
 
 
311 aa  609  1e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5664  phosphate-starvation-inducible E  90.67 
 
 
150 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6412  phosphate-starvation-inducible E  90 
 
 
150 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397536  normal  0.168082 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7003  phosphate-starvation-inducible protein E  91.33 
 
 
149 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6017  phosphate-starvation-inducible E  97.33 
 
 
150 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134079  normal  0.333922 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5416  phosphate-starvation-inducible E  91.1 
 
 
150 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370602  normal  0.100084 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0609  phosphate-starvation-inducible E  47.15 
 
 
149 aa  99.4  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1771  phosphate-starvation-inducible E  44.74 
 
 
132 aa  90.5  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1453  phosphate-starvation-inducible E  39.67 
 
 
134 aa  86.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152108  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1483  phosphate-starvation-inducible E  38.4 
 
 
135 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.213148  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2429  phosphate-starvation-inducible E  44.44 
 
 
138 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.357601  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4769  phosphate-starvation-inducible E  40.38 
 
 
149 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4082  phosphate-starvation-inducible E  45 
 
 
144 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142124  normal  0.346542 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1664  phosphate-starvation-inducible E  39.84 
 
 
134 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00845708  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1679  phosphate-starvation-inducible E  39.84 
 
 
134 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1701  phosphate-starvation-inducible E  39.84 
 
 
134 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.227884  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2678  phosphate-starvation-inducible E  39.84 
 
 
134 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001849  hypothetical protein  38.93 
 
 
141 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00644  hypothetical protein  36.67 
 
 
141 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2877  phosphate-starvation-inducible E  44.09 
 
 
134 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.183291  hitchhiker  0.000000000937357 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1287  hypothetical protein  45.16 
 
 
134 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.369576  normal  0.0154285 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2323  phosphate-starvation-inducible E  45.16 
 
 
134 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0428039  normal  0.646848 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0209  phosphate-starvation-inducible E  45.88 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.515873  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1458  phosphate-starvation-inducible E  43.97 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2806  hypothetical protein  40.65 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2588  phosphate-starvation-inducible E  40.65 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147474  normal  0.02952 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2496  phosphate-starvation-inducible E  40.65 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.794951  normal  0.0438404 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2426  phosphate-starvation-inducible E  40.65 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160666  normal  0.0424424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0824  phosphate-starvation-inducible E  37.7 
 
 
157 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1887  phosphate-starvation-inducible E  37.76 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.549382  normal  0.718455 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1554  phosphate-starvation-inducible E  40.65 
 
 
134 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2600  hypothetical protein  49.14 
 
 
141 aa  68.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.419221  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0917  phosphate-starvation-inducible E  33.05 
 
 
166 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1200  hypothetical protein  33.61 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1034  phosphate-starvation-inducible E  33.61 
 
 
162 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1814  phosphate-starvation-inducible E  33.91 
 
 
158 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.603697  normal  0.0742718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4599  phosphate-starvation-inducible E  35.85 
 
 
156 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4473  phosphate-starvation-inducible E  34.91 
 
 
156 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.317016  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4615  phosphate-starvation-inducible E  34.91 
 
 
156 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1049  phosphate-starvation-inducible E  37.76 
 
 
126 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196003  normal  0.502464 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6224  hypothetical protein  37.76 
 
 
126 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.876255  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0727  phosphate-starvation-inducible E  33.64 
 
 
152 aa  58.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10810  Phosphate-starvation-inducible E (PsiE) protein  33.64 
 
 
166 aa  56.6  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.301134  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0900  phosphate-starvation-inducible E  32.81 
 
 
139 aa  55.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1727  hypothetical protein  38.78 
 
 
161 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0263  phosphate-starvation-inducible E  41.35 
 
 
140 aa  53.5  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20070  hypothetical protein  37.76 
 
 
161 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.764079  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3240  phosphate-starvation-inducible E  34.18 
 
 
164 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240832  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0641  phosphate-starvation-inducible E  32.52 
 
 
165 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.252997  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>