54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5664 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5664  phosphate-starvation-inducible E  100 
 
 		 150 aa  299  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6412  phosphate-starvation-inducible E  98.67 
 
 		 150 aa  293  7e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397536  normal  0.168082 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7003  phosphate-starvation-inducible protein E  90.67 
 
 		 149 aa  265  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.892568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6017  phosphate-starvation-inducible E  92.67 
 
 		 150 aa  261  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134079  normal  0.333922 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5416  phosphate-starvation-inducible E  86.67 
 
 		 150 aa  254  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370602  normal  0.100084 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6427  phosphate-starvation-inducible E  93.43 
 
 		 319 aa  234  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1402  phosphate-starvation-inducible E  93.43 
 
 		 311 aa  234  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0609  phosphate-starvation-inducible E  46.88 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.233674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1771  phosphate-starvation-inducible E  45.69 
 
 		 132 aa  91.7  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1453  phosphate-starvation-inducible E  40.5 
 
 		 134 aa  87.8  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152108  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1483  phosphate-starvation-inducible E  39.2 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.213148  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2429  phosphate-starvation-inducible E  45.37 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.357601  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4082  phosphate-starvation-inducible E  42.48 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142124  normal  0.346542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4769  phosphate-starvation-inducible E  39.42 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1664  phosphate-starvation-inducible E  41.32 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00845708  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1679  phosphate-starvation-inducible E  41.32 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1701  phosphate-starvation-inducible E  42.11 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.227884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2678  phosphate-starvation-inducible E  42.11 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001849  hypothetical protein  38.17 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2877  phosphate-starvation-inducible E  44.09 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.183291  hitchhiker  0.000000000937357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2323  phosphate-starvation-inducible E  45.1 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0428039  normal  0.646848 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00644  hypothetical protein  34.68 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1287  hypothetical protein  45.16 
 
 		 134 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.369576  normal  0.0154285 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1458  phosphate-starvation-inducible E  42.11 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0209  phosphate-starvation-inducible E  44.71 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.515873  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0824  phosphate-starvation-inducible E  39.64 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2806  hypothetical protein  42.98 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2426  phosphate-starvation-inducible E  42.98 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160666  normal  0.0424424 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2588  phosphate-starvation-inducible E  42.98 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147474  normal  0.02952 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2496  phosphate-starvation-inducible E  42.98 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.794951  normal  0.0438404 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2600  hypothetical protein  43.8 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.419221  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1554  phosphate-starvation-inducible E  42.98 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0917  phosphate-starvation-inducible E  33.9 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1887  phosphate-starvation-inducible E  37.76 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.549382  normal  0.718455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1200  hypothetical protein  34.68 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1034  phosphate-starvation-inducible E  34.68 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4599  phosphate-starvation-inducible E  34.01 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4615  phosphate-starvation-inducible E  33.58 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4473  phosphate-starvation-inducible E  33.58 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.317016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1049  phosphate-starvation-inducible E  38.78 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.196003  normal  0.502464 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6224  hypothetical protein  38.78 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.876255  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1814  phosphate-starvation-inducible E  32.77 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.603697  normal  0.0742718 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0900  phosphate-starvation-inducible E  32.35 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10810  Phosphate-starvation-inducible E (PsiE) protein  32.71 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.301134  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0727  phosphate-starvation-inducible E  31.9 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0263  phosphate-starvation-inducible E  43.01 
 
 		 140 aa  52  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1727  hypothetical protein  37.76 
 
 		 161 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20070  hypothetical protein  34.02 
 
 		 161 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.764079  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3240  phosphate-starvation-inducible E  37.14 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0641  phosphate-starvation-inducible E  30.71 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.252997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3208  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  23.62 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0836  hypothetical protein  33.33 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1752  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  24.07 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.104619  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3496  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  24.07 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>