67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0303 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0375  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  100 
 
 
135 aa  267  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.602786  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3917  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  100 
 
 
135 aa  267  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.587769  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0303  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  100 
 
 
135 aa  267  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.30182e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4475  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  85.93 
 
 
135 aa  221  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2978  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  76.3 
 
 
135 aa  210  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2710  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  76.3 
 
 
135 aa  209  1e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.275829  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1302  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  75.56 
 
 
135 aa  208  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1198  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  71.85 
 
 
135 aa  198  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0915871  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0235  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  65.91 
 
 
136 aa  180  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.624276 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3966  phosphate-starvation-inducible E  65.41 
 
 
136 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03862  hypothetical protein  65.41 
 
 
136 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4493  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  65.41 
 
 
136 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0800783  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3999  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  65.41 
 
 
136 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.511957 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4581  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  65.41 
 
 
136 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4270  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  65.41 
 
 
136 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03902  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  65.41 
 
 
136 aa  160  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5511  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  65.41 
 
 
136 aa  160  8.000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0020  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  61.11 
 
 
134 aa  156  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.38872 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4483  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  65.41 
 
 
136 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4417  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  65.41 
 
 
136 aa  155  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00553621 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5221  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  57.14 
 
 
133 aa  156  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4620  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  64.66 
 
 
136 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.181005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4568  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  64.66 
 
 
136 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.745601 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4568  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  64.66 
 
 
136 aa  155  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0208216 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4908  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  58.91 
 
 
134 aa  155  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5225  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  61.11 
 
 
134 aa  155  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00583254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5191  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  58.14 
 
 
134 aa  154  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4946  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  58.14 
 
 
134 aa  154  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4789  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  58.14 
 
 
134 aa  154  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4807  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  58.14 
 
 
134 aa  154  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5324  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  58.14 
 
 
134 aa  154  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5242  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  58.14 
 
 
147 aa  153  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4537  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  64.39 
 
 
132 aa  149  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3208  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  57.38 
 
 
141 aa  144  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3496  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  56.56 
 
 
140 aa  141  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1752  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  55.74 
 
 
140 aa  140  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.104619  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3654  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  60 
 
 
135 aa  122  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0690  hypothetical protein  31.93 
 
 
135 aa  67  0.00000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000236422  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1534  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  35.11 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000577717  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1549  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  25.23 
 
 
134 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000247347  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0917  phosphate-starvation-inducible E  38.96 
 
 
166 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1034  phosphate-starvation-inducible E  39.76 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10810  Phosphate-starvation-inducible E (PsiE) protein  36 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.301134  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4615  phosphate-starvation-inducible E  36.11 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1200  hypothetical protein  40.58 
 
 
162 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4599  phosphate-starvation-inducible E  36.11 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4473  phosphate-starvation-inducible E  36.11 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.317016  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4082  phosphate-starvation-inducible E  28.57 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142124  normal  0.346542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0824  phosphate-starvation-inducible E  36.11 
 
 
157 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.827402  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3240  phosphate-starvation-inducible E  37.25 
 
 
164 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240832  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0727  phosphate-starvation-inducible E  36.62 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0900  phosphate-starvation-inducible E  30 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20070  hypothetical protein  34.38 
 
 
161 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.764079  normal  0.976182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1771  phosphate-starvation-inducible E  30.08 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.358741  hitchhiker  0.00165952 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1727  hypothetical protein  35.48 
 
 
161 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2678  phosphate-starvation-inducible E  26.56 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0179577 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1701  phosphate-starvation-inducible E  26.56 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.227884  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0170  phosphate-starvation-inducible protein PsiE  24.72 
 
 
133 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.213754  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2806  hypothetical protein  29.69 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2426  phosphate-starvation-inducible E  29.69 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.160666  normal  0.0424424 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2588  phosphate-starvation-inducible E  29.69 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.147474  normal  0.02952 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2496  phosphate-starvation-inducible E  29.69 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.794951  normal  0.0438404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4769  phosphate-starvation-inducible E  37.88 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1664  phosphate-starvation-inducible E  26.4 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00845708  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1679  phosphate-starvation-inducible E  26.4 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2429  phosphate-starvation-inducible E  31.43 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.357601  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1453  phosphate-starvation-inducible E  36.23 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00152108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>