64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0231 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0231  putative integral membrane protein  100 
 
 		 226 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2100  putative integral membrane protein  59.46 
 
 		 242 aa  278  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2287  putative integral membrane protein  57.08 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3786  putative integral membrane protein  38.95 
 
 		 211 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3222  putative integral membrane protein  41.57 
 
 		 209 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0729  hypothetical protein  34.8 
 
 		 195 aa  125  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2271  inner membrane protein  35.38 
 
 		 202 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00647777  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2717  hypothetical protein  40.24 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000175  predicted membrane protein  35.55 
 
 		 198 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.313152  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02239  hypothetical protein  38.67 
 
 		 189 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.516407  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45580  hypothetical protein  43.5 
 
 		 200 aa  115  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05809  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  114  8.999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3586  membrane protein  37.84 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1503  hypothetical protein  33.68 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3725  hypothetical protein  36.6 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0293882  normal  0.0191328 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0862  hypothetical protein  36.51 
 
 		 202 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3501  hypothetical protein  36.72 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0874  hypothetical protein  36.72 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0839  hypothetical protein  35.96 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3888  hypothetical protein  33.7 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.440591  hitchhiker  0.00000179046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3195  hypothetical protein  33.68 
 
 		 201 aa  104  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3088  membrane protein  35.52 
 
 		 210 aa  104  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0559  hypothetical protein  34.54 
 
 		 207 aa  104  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2951  hypothetical protein  35.8 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.121286 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0432  hypothetical protein  31.98 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000241579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0791  hypothetical protein  33.86 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.639619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4115  hypothetical protein  35.33 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0122  hypothetical protein  32.72 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218524  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4141  hypothetical protein  35.33 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0863  hypothetical protein  35.29 
 
 		 201 aa  101  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3138  hypothetical protein  34.83 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0361  hypothetical protein  36.05 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0630754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2566  hypothetical protein  32.29 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3946  hypothetical protein  32.61 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0184701  normal  0.814142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0632  hypothetical protein  32.04 
 
 		 204 aa  99.8  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40140  hypothetical protein  34.18 
 
 		 211 aa  99.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2193  hypothetical protein  32.72 
 
 		 208 aa  98.6  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000177345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2447  hypothetical protein  33.15 
 
 		 204 aa  98.6  7e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0351  putative integral membrane protein  27.92 
 
 		 228 aa  98.6  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0966  hypothetical protein  33.54 
 
 		 220 aa  98.6  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.218767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3415  hypothetical protein  36.36 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4587  hypothetical protein  34.05 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3906  hypothetical protein  33.68 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5635  hypothetical protein  33.68 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3871  conserved hypothetical protein  33.16 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4675  hypothetical protein  33.16 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0719  hypothetical protein  36.36 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.015422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3270  hypothetical protein  35.05 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4362  hypothetical protein  33.16 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0912  hypothetical protein  31.86 
 
 		 205 aa  96.3  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3367  hypothetical protein  34.36 
 
 		 221 aa  96.3  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0785  putative sodium-glucose/galactose cotransporter  36.76 
 
 		 199 aa  95.5  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3999  hypothetical protein  34.24 
 
 		 215 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3303  hypothetical protein  34.39 
 
 		 202 aa  95.1  8e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03953  hypothetical protein  32.63 
 
 		 209 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03992  conserved inner membrane protein  32.63 
 
 		 209 aa  94.7  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2537  hypothetical protein  33.51 
 
 		 185 aa  94.4  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0049901  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2635  putative sodium-glucose/galactose cotransporter  35.56 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.240202  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3321  hypothetical protein  32.54 
 
 		 203 aa  93.2  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2565  hypothetical protein  31.1 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 206 aa  89.7  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.554323 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1302  hypothetical protein  31.98 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.189923  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3433  hypothetical protein  32.12 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5277  hypothetical protein  32.49 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.466735  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>