65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1302 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1302  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.189923  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0632  hypothetical protein  59.49 
 
 		 204 aa  246  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3321  hypothetical protein  61.78 
 
 		 203 aa  245  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3888  hypothetical protein  58.73 
 
 		 200 aa  240  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.440591  hitchhiker  0.00000179046 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3586  membrane protein  59.47 
 
 		 201 aa  237  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3946  hypothetical protein  57.07 
 
 		 203 aa  237  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0184701  normal  0.814142 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0559  hypothetical protein  55.44 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0839  hypothetical protein  56.25 
 
 		 202 aa  231  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3195  hypothetical protein  57.67 
 
 		 201 aa  230  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2537  hypothetical protein  59.34 
 
 		 185 aa  229  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0049901  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0862  hypothetical protein  55.73 
 
 		 202 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0874  hypothetical protein  55.73 
 
 		 202 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3501  hypothetical protein  55.73 
 
 		 202 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0863  hypothetical protein  55.33 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3138  hypothetical protein  54.04 
 
 		 202 aa  222  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3303  hypothetical protein  54.59 
 
 		 202 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0719  hypothetical protein  54.12 
 
 		 202 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.015422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2566  hypothetical protein  53.59 
 
 		 202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3415  hypothetical protein  53.93 
 
 		 202 aa  211  7e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3088  membrane protein  49.46 
 
 		 210 aa  188  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40140  hypothetical protein  51.67 
 
 		 211 aa  182  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4675  hypothetical protein  47.57 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3871  conserved hypothetical protein  47.57 
 
 		 209 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5635  hypothetical protein  47.03 
 
 		 209 aa  178  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3906  hypothetical protein  47.03 
 
 		 209 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4362  hypothetical protein  47.03 
 
 		 209 aa  177  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03953  hypothetical protein  46.49 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03992  conserved inner membrane protein  46.49 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4115  hypothetical protein  50.28 
 
 		 215 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3433  hypothetical protein  48.21 
 
 		 213 aa  174  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4141  hypothetical protein  50.28 
 
 		 215 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3999  hypothetical protein  49.72 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3725  hypothetical protein  46.93 
 
 		 212 aa  171  5e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0293882  normal  0.0191328 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4587  hypothetical protein  45.95 
 
 		 209 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3386  hypothetical protein  44.86 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.554323 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2635  putative sodium-glucose/galactose cotransporter  49.07 
 
 		 194 aa  168  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.240202  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5277  hypothetical protein  45.05 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.466735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0122  hypothetical protein  45.45 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218524  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3270  hypothetical protein  44.88 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2193  hypothetical protein  43.85 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000177345  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0912  hypothetical protein  45 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3367  hypothetical protein  47.12 
 
 		 221 aa  157  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2565  hypothetical protein  38.78 
 
 		 210 aa  157  8e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0785  putative sodium-glucose/galactose cotransporter  38.04 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0361  hypothetical protein  47.73 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0630754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2447  hypothetical protein  41.85 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224558  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05809  hypothetical protein  35.9 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0729  hypothetical protein  40.33 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0432  hypothetical protein  33.68 
 
 		 206 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000241579  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2287  putative integral membrane protein  37.87 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2271  inner membrane protein  36.11 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00647777  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000175  predicted membrane protein  35.91 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.313152  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1503  hypothetical protein  33.52 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2951  hypothetical protein  35.03 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.121286 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0791  hypothetical protein  32.94 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.639619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0351  putative integral membrane protein  31.46 
 
 		 228 aa  91.7  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3786  putative integral membrane protein  29.79 
 
 		 211 aa  91.3  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2100  putative integral membrane protein  31.16 
 
 		 242 aa  89.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0231  putative integral membrane protein  31.98 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45580  hypothetical protein  37.35 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2717  hypothetical protein  28.49 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02239  hypothetical protein  28.41 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.516407  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3222  putative integral membrane protein  30 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0966  hypothetical protein  30.61 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.218767 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2438  hypothetical protein  29.57 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>