65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_4141 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_4141  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3999  hypothetical protein  96.28 
 
 		 215 aa  360  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4115  hypothetical protein  92.56 
 
 		 215 aa  330  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0361  hypothetical protein  82.02 
 
 		 220 aa  266  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0630754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3270  hypothetical protein  66 
 
 		 217 aa  240  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0912  hypothetical protein  60.8 
 
 		 205 aa  238  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3088  membrane protein  60.61 
 
 		 210 aa  238  8e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3386  hypothetical protein  59.79 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.554323 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40140  hypothetical protein  59.51 
 
 		 211 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4675  hypothetical protein  60.22 
 
 		 209 aa  228  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4362  hypothetical protein  59.68 
 
 		 209 aa  226  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03992  conserved inner membrane protein  59.68 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03953  hypothetical protein  59.68 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3906  hypothetical protein  59.14 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5635  hypothetical protein  59.14 
 
 		 209 aa  225  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3871  conserved hypothetical protein  59.68 
 
 		 209 aa  225  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3888  hypothetical protein  54.17 
 
 		 200 aa  225  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.440591  hitchhiker  0.00000179046 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3367  hypothetical protein  57.87 
 
 		 221 aa  224  8e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4587  hypothetical protein  59.14 
 
 		 209 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5277  hypothetical protein  57.65 
 
 		 221 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.466735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2566  hypothetical protein  51.91 
 
 		 202 aa  219  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2447  hypothetical protein  59.14 
 
 		 204 aa  218  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224558  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3195  hypothetical protein  54.97 
 
 		 201 aa  217  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0632  hypothetical protein  54.45 
 
 		 204 aa  216  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3586  membrane protein  54.59 
 
 		 201 aa  214  7e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3138  hypothetical protein  55.03 
 
 		 202 aa  214  8e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0839  hypothetical protein  54 
 
 		 202 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3946  hypothetical protein  52.36 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0184701  normal  0.814142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0863  hypothetical protein  52.22 
 
 		 201 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0874  hypothetical protein  54 
 
 		 202 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3501  hypothetical protein  54 
 
 		 202 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0862  hypothetical protein  53 
 
 		 202 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3725  hypothetical protein  57.45 
 
 		 212 aa  204  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0293882  normal  0.0191328 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3415  hypothetical protein  55.38 
 
 		 202 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0719  hypothetical protein  52.5 
 
 		 202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.015422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3303  hypothetical protein  52.97 
 
 		 202 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2565  hypothetical protein  49.25 
 
 		 210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3321  hypothetical protein  48.24 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0785  putative sodium-glucose/galactose cotransporter  45.45 
 
 		 199 aa  193  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0559  hypothetical protein  49.18 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2537  hypothetical protein  46.81 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0049901  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3433  hypothetical protein  48.21 
 
 		 213 aa  189  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1302  hypothetical protein  48.72 
 
 		 200 aa  185  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.189923  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2635  putative sodium-glucose/galactose cotransporter  45.56 
 
 		 194 aa  179  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.240202  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0122  hypothetical protein  44.04 
 
 		 208 aa  178  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2193  hypothetical protein  43.01 
 
 		 208 aa  174  7e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000177345  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0432  hypothetical protein  40.78 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000241579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2951  hypothetical protein  45.03 
 
 		 211 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.121286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45580  hypothetical protein  46.2 
 
 		 200 aa  121  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2287  putative integral membrane protein  40.59 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0791  hypothetical protein  38.86 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.639619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2100  putative integral membrane protein  35.48 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0231  putative integral membrane protein  35.33 
 
 		 226 aa  105  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1503  hypothetical protein  37.7 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3786  putative integral membrane protein  31.55 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0729  hypothetical protein  34.07 
 
 		 195 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2271  inner membrane protein  35.75 
 
 		 202 aa  99  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00647777  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05809  hypothetical protein  32.99 
 
 		 198 aa  97.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000175  predicted membrane protein  32.43 
 
 		 198 aa  96.7  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.313152  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0351  putative integral membrane protein  31.41 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02239  hypothetical protein  36.48 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.516407  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2717  hypothetical protein  37.58 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3222  putative integral membrane protein  35.98 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0966  hypothetical protein  35.21 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.218767 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2438  hypothetical protein  34.29 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>