65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3586 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3586  membrane protein  100 
 
 		 201 aa  408  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3195  hypothetical protein  69.9 
 
 		 201 aa  290  7e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3888  hypothetical protein  67.51 
 
 		 200 aa  286  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.440591  hitchhiker  0.00000179046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3946  hypothetical protein  66.33 
 
 		 203 aa  286  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0184701  normal  0.814142 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0632  hypothetical protein  68.75 
 
 		 204 aa  280  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0862  hypothetical protein  64.5 
 
 		 202 aa  271  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3138  hypothetical protein  65.48 
 
 		 202 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0839  hypothetical protein  64.82 
 
 		 202 aa  271  6e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3501  hypothetical protein  64 
 
 		 202 aa  271  7e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0874  hypothetical protein  64 
 
 		 202 aa  271  7e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0863  hypothetical protein  63.82 
 
 		 201 aa  269  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3321  hypothetical protein  62.44 
 
 		 203 aa  259  1e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0559  hypothetical protein  62.18 
 
 		 207 aa  259  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3415  hypothetical protein  64 
 
 		 202 aa  254  6e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0719  hypothetical protein  64 
 
 		 202 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.015422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3303  hypothetical protein  63.5 
 
 		 202 aa  251  7e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2537  hypothetical protein  62.23 
 
 		 185 aa  247  7e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0049901  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3088  membrane protein  58.5 
 
 		 210 aa  241  6e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1302  hypothetical protein  59.47 
 
 		 200 aa  237  6.999999999999999e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.189923  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2566  hypothetical protein  59.46 
 
 		 202 aa  235  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40140  hypothetical protein  54.12 
 
 		 211 aa  209  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3725  hypothetical protein  55.08 
 
 		 212 aa  208  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0293882  normal  0.0191328 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2635  putative sodium-glucose/galactose cotransporter  56.36 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.240202  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3386  hypothetical protein  53.16 
 
 		 206 aa  204  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.554323 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3270  hypothetical protein  55.21 
 
 		 217 aa  203  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3871  conserved hypothetical protein  51.34 
 
 		 209 aa  201  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4675  hypothetical protein  52.2 
 
 		 209 aa  201  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4115  hypothetical protein  54.4 
 
 		 215 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0912  hypothetical protein  48.69 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4362  hypothetical protein  52.2 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5635  hypothetical protein  51.65 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4141  hypothetical protein  54.95 
 
 		 215 aa  198  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3906  hypothetical protein  51.65 
 
 		 209 aa  198  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03953  hypothetical protein  51.65 
 
 		 209 aa  198  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03992  conserved inner membrane protein  51.65 
 
 		 209 aa  198  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3999  hypothetical protein  54.95 
 
 		 215 aa  197  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4587  hypothetical protein  51.1 
 
 		 209 aa  194  9e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5277  hypothetical protein  53.23 
 
 		 221 aa  193  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.466735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3367  hypothetical protein  53.85 
 
 		 221 aa  192  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0361  hypothetical protein  53.89 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0630754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0785  putative sodium-glucose/galactose cotransporter  49.46 
 
 		 199 aa  188  5e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2565  hypothetical protein  46.67 
 
 		 210 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3433  hypothetical protein  53.68 
 
 		 213 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2447  hypothetical protein  48.37 
 
 		 204 aa  171  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224558  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0122  hypothetical protein  44.74 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2193  hypothetical protein  43.68 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000177345  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05809  hypothetical protein  40.64 
 
 		 198 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2287  putative integral membrane protein  40.34 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2271  inner membrane protein  37.91 
 
 		 202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00647777  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2100  putative integral membrane protein  37.17 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0729  hypothetical protein  37.91 
 
 		 195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000175  predicted membrane protein  37.63 
 
 		 198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.313152  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0432  hypothetical protein  36.22 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000241579  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0231  putative integral membrane protein  37.84 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45580  hypothetical protein  40 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2951  hypothetical protein  37.72 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.121286 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1503  hypothetical protein  37.57 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0791  hypothetical protein  35.8 
 
 		 208 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.639619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3786  putative integral membrane protein  32.24 
 
 		 211 aa  93.2  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0351  putative integral membrane protein  32.56 
 
 		 228 aa  89  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2717  hypothetical protein  37.41 
 
 		 209 aa  87  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3222  putative integral membrane protein  30.9 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02239  hypothetical protein  28.75 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.516407  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0966  hypothetical protein  35.46 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.218767 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2438  hypothetical protein  33.02 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>