65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_40140 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_40140  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0912  hypothetical protein  64.22 
 
 
205 aa  264  5.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169458  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3725  hypothetical protein  65.61 
 
 
212 aa  245  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0293882  normal  0.0191328 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3386  hypothetical protein  61.62 
 
 
206 aa  240  1e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.554323 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3906  hypothetical protein  62.98 
 
 
209 aa  236  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5635  hypothetical protein  62.98 
 
 
209 aa  236  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4675  hypothetical protein  62.98 
 
 
209 aa  236  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4362  hypothetical protein  62.98 
 
 
209 aa  235  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03953  hypothetical protein  62.98 
 
 
209 aa  234  6e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03992  conserved inner membrane protein  62.98 
 
 
209 aa  234  6e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3871  conserved hypothetical protein  61.17 
 
 
209 aa  234  7e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4587  hypothetical protein  62.43 
 
 
209 aa  231  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3088  membrane protein  56.92 
 
 
210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3999  hypothetical protein  63.3 
 
 
215 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4115  hypothetical protein  64.64 
 
 
215 aa  210  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0863  hypothetical protein  56.06 
 
 
201 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3586  membrane protein  54.12 
 
 
201 aa  209  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3138  hypothetical protein  55.72 
 
 
202 aa  208  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4141  hypothetical protein  61.7 
 
 
215 aa  207  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3888  hypothetical protein  53.65 
 
 
200 aa  207  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.440591  hitchhiker  0.00000179046 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3946  hypothetical protein  53.93 
 
 
203 aa  205  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0184701  normal  0.814142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0839  hypothetical protein  56.91 
 
 
202 aa  205  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2447  hypothetical protein  58.56 
 
 
204 aa  202  2e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0874  hypothetical protein  55.85 
 
 
202 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3415  hypothetical protein  57.75 
 
 
202 aa  202  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0719  hypothetical protein  56.06 
 
 
202 aa  202  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.015422  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0862  hypothetical protein  55.85 
 
 
202 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3501  hypothetical protein  55.85 
 
 
202 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3195  hypothetical protein  54.64 
 
 
201 aa  202  4e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3270  hypothetical protein  59.8 
 
 
217 aa  201  7e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0361  hypothetical protein  63.13 
 
 
220 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0630754  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3303  hypothetical protein  56.57 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3367  hypothetical protein  58.64 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0632  hypothetical protein  53.76 
 
 
204 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0559  hypothetical protein  52.55 
 
 
207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3321  hypothetical protein  52.22 
 
 
203 aa  193  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2566  hypothetical protein  49.45 
 
 
202 aa  192  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0785  putative sodium-glucose/galactose cotransporter  45.27 
 
 
199 aa  190  1e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.648751  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2537  hypothetical protein  53.16 
 
 
185 aa  189  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0049901  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1302  hypothetical protein  51.67 
 
 
200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.189923  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5277  hypothetical protein  51.35 
 
 
221 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.466735  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3433  hypothetical protein  47.47 
 
 
213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2635  putative sodium-glucose/galactose cotransporter  45.03 
 
 
194 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.240202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2565  hypothetical protein  41.67 
 
 
210 aa  158  7e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0122  hypothetical protein  39.8 
 
 
208 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2193  hypothetical protein  40.2 
 
 
208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000177345  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2951  hypothetical protein  40.33 
 
 
211 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.121286 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0432  hypothetical protein  38.6 
 
 
206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000241579  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2100  putative integral membrane protein  39.8 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0791  hypothetical protein  35.91 
 
 
208 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.639619  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000175  predicted membrane protein  33.33 
 
 
198 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.313152  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0729  hypothetical protein  36.98 
 
 
195 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2271  inner membrane protein  32.8 
 
 
202 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00647777  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05809  hypothetical protein  32.02 
 
 
198 aa  101  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2287  putative integral membrane protein  37.76 
 
 
251 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224582  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1503  hypothetical protein  38.76 
 
 
203 aa  99.4  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0231  putative integral membrane protein  34.18 
 
 
226 aa  99.4  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45580  hypothetical protein  41.14 
 
 
200 aa  97.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3786  putative integral membrane protein  33.89 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0351  putative integral membrane protein  31.05 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2717  hypothetical protein  39.1 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3222  putative integral membrane protein  35.48 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02239  hypothetical protein  33.79 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.516407  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0966  hypothetical protein  34.81 
 
 
220 aa  55.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.218767 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1229  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  28.57 
 
 
466 aa  42  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>