64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3786 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3786  putative integral membrane protein  100 
 
 		 211 aa  430  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2287  putative integral membrane protein  37.22 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0231  putative integral membrane protein  38.95 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2100  putative integral membrane protein  42.51 
 
 		 242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45580  hypothetical protein  43.4 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000175  predicted membrane protein  34.33 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.313152  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0785  putative sodium-glucose/galactose cotransporter  36.67 
 
 		 199 aa  114  7.999999999999999e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05809  hypothetical protein  38.93 
 
 		 198 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0729  hypothetical protein  37.35 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0791  hypothetical protein  40.26 
 
 		 208 aa  108  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.639619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5277  hypothetical protein  32.09 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.466735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0912  hypothetical protein  34.08 
 
 		 205 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0432  hypothetical protein  34.97 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000241579  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0122  hypothetical protein  34.02 
 
 		 208 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218524  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3725  hypothetical protein  36.02 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0293882  normal  0.0191328 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2951  hypothetical protein  36.47 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.121286 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2193  hypothetical protein  36.22 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000177345  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2717  hypothetical protein  34.5 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3386  hypothetical protein  34.47 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.554323 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2271  inner membrane protein  35.06 
 
 		 202 aa  101  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00647777  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3999  hypothetical protein  32.64 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2565  hypothetical protein  34.02 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4141  hypothetical protein  32.64 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3888  hypothetical protein  32.61 
 
 		 200 aa  98.6  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.440591  hitchhiker  0.00000179046 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2447  hypothetical protein  34.04 
 
 		 204 aa  98.2  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224558  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40140  hypothetical protein  33.89 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1503  hypothetical protein  34.91 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4115  hypothetical protein  34.91 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3871  conserved hypothetical protein  33.7 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4675  hypothetical protein  33.7 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0351  putative integral membrane protein  33.33 
 
 		 228 aa  95.9  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3946  hypothetical protein  30.98 
 
 		 203 aa  95.9  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0184701  normal  0.814142 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2566  hypothetical protein  32.18 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4362  hypothetical protein  33.7 
 
 		 209 aa  95.5  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0361  hypothetical protein  36.75 
 
 		 220 aa  95.1  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0630754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03953  hypothetical protein  33.7 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5635  hypothetical protein  32.97 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03992  conserved inner membrane protein  33.7 
 
 		 209 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3906  hypothetical protein  32.97 
 
 		 209 aa  94  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02239  hypothetical protein  32.52 
 
 		 189 aa  94  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.516407  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3270  hypothetical protein  34.43 
 
 		 217 aa  93.2  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3088  membrane protein  32.61 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3586  membrane protein  32.24 
 
 		 201 aa  93.2  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4587  hypothetical protein  33.33 
 
 		 209 aa  91.7  7e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0559  hypothetical protein  31.49 
 
 		 207 aa  91.7  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1302  hypothetical protein  29.79 
 
 		 200 aa  91.3  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.189923  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3195  hypothetical protein  31 
 
 		 201 aa  91.3  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0632  hypothetical protein  31.44 
 
 		 204 aa  91.3  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0874  hypothetical protein  31.16 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3501  hypothetical protein  31.16 
 
 		 202 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3138  hypothetical protein  31.25 
 
 		 202 aa  89.4  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0863  hypothetical protein  31.46 
 
 		 201 aa  89.4  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0839  hypothetical protein  31.16 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0862  hypothetical protein  31.16 
 
 		 202 aa  88.6  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3433  hypothetical protein  32.07 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3367  hypothetical protein  31.35 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3222  putative integral membrane protein  33.52 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2635  putative sodium-glucose/galactose cotransporter  33.94 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.240202  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2537  hypothetical protein  29.82 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0049901  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3303  hypothetical protein  30.9 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3321  hypothetical protein  28.5 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0966  hypothetical protein  31.68 
 
 		 220 aa  81.3  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.218767 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0719  hypothetical protein  30.29 
 
 		 202 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.015422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3415  hypothetical protein  29.71 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>