64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0912 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0912  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.169458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40140  hypothetical protein  64.22 
 
 		 211 aa  264  5e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3386  hypothetical protein  63.49 
 
 		 206 aa  252  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.554323 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3725  hypothetical protein  65.08 
 
 		 212 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0293882  normal  0.0191328 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4675  hypothetical protein  63.59 
 
 		 209 aa  252  3e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03992  conserved inner membrane protein  63.59 
 
 		 209 aa  251  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4362  hypothetical protein  63.59 
 
 		 209 aa  251  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03953  hypothetical protein  63.59 
 
 		 209 aa  251  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5635  hypothetical protein  63.04 
 
 		 209 aa  251  6e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3906  hypothetical protein  63.04 
 
 		 209 aa  251  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3871  conserved hypothetical protein  63.04 
 
 		 209 aa  249  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4587  hypothetical protein  63.39 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3088  membrane protein  52.02 
 
 		 210 aa  223  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431554  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3888  hypothetical protein  53.93 
 
 		 200 aa  216  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.440591  hitchhiker  0.00000179046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3195  hypothetical protein  54.45 
 
 		 201 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4115  hypothetical protein  59.8 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3999  hypothetical protein  60.1 
 
 		 215 aa  210  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4141  hypothetical protein  62.64 
 
 		 215 aa  209  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0632  hypothetical protein  55.38 
 
 		 204 aa  206  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3270  hypothetical protein  61.26 
 
 		 217 aa  204  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0839  hypothetical protein  52.6 
 
 		 202 aa  201  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3586  membrane protein  48.69 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0874  hypothetical protein  52.08 
 
 		 202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3501  hypothetical protein  52.08 
 
 		 202 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0361  hypothetical protein  59.89 
 
 		 220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0630754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0862  hypothetical protein  51.56 
 
 		 202 aa  199  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3946  hypothetical protein  49.47 
 
 		 203 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0184701  normal  0.814142 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3367  hypothetical protein  53.65 
 
 		 221 aa  194  8.000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3138  hypothetical protein  50 
 
 		 202 aa  193  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0559  hypothetical protein  50.27 
 
 		 207 aa  192  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2566  hypothetical protein  48.63 
 
 		 202 aa  192  4e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.991999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2447  hypothetical protein  53.04 
 
 		 204 aa  191  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.224558  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0863  hypothetical protein  49.21 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5277  hypothetical protein  50.53 
 
 		 221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.466735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3321  hypothetical protein  48.28 
 
 		 203 aa  188  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3303  hypothetical protein  50.26 
 
 		 202 aa  184  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3415  hypothetical protein  49.74 
 
 		 202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0785  putative sodium-glucose/galactose cotransporter  44.62 
 
 		 199 aa  181  6e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2537  hypothetical protein  48.39 
 
 		 185 aa  181  8.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.0049901  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0719  hypothetical protein  49.21 
 
 		 202 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.015422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1302  hypothetical protein  45 
 
 		 200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.189923  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3433  hypothetical protein  43.08 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132971 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2635  putative sodium-glucose/galactose cotransporter  42.94 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.240202  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2565  hypothetical protein  40.78 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0122  hypothetical protein  39.6 
 
 		 208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.218524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2193  hypothetical protein  39.11 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000177345  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0432  hypothetical protein  34 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000241579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0791  hypothetical protein  32.34 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.639619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3786  putative integral membrane protein  34.08 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2100  putative integral membrane protein  35.23 
 
 		 242 aa  105  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2287  putative integral membrane protein  37.85 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.224582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2951  hypothetical protein  37.65 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.121286 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0231  putative integral membrane protein  31.86 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0729  hypothetical protein  33.71 
 
 		 195 aa  95.5  5e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1503  hypothetical protein  32.16 
 
 		 203 aa  95.1  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45580  hypothetical protein  37.18 
 
 		 200 aa  93.2  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2271  inner membrane protein  29.9 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00647777  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000175  predicted membrane protein  28.25 
 
 		 198 aa  88.6  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.313152  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05809  hypothetical protein  32.31 
 
 		 198 aa  86.3  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0351  putative integral membrane protein  30.09 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3222  putative integral membrane protein  33.13 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2717  hypothetical protein  30.59 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02239  hypothetical protein  32.61 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.516407  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0966  hypothetical protein  31.72 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.218767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>