37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1389 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1389  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.16332e-16 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1424  hypothetical protein  49.31 
 
 		 346 aa  252  7e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000647659  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1161  hypothetical protein  49.31 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000610195  hitchhiker  1.74313e-19 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1756  hypothetical protein  49.48 
 
 		 346 aa  249  5e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000208763  hitchhiker  0.000309878 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3166  hypothetical protein  48.62 
 
 		 346 aa  249  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000168095  hitchhiker  1.83761e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1833  hypothetical protein  48.62 
 
 		 346 aa  249  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000938078  decreased coverage  0.0000000000000142087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1510  hypothetical protein  56.43 
 
 		 345 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.403027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2209  hypothetical protein  65.26 
 
 		 347 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00285391  decreased coverage  5.0069399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2808  hypothetical protein  54.55 
 
 		 345 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2284  protein of unknown function DUF1376  69.59 
 
 		 285 aa  210  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2262  Pyocin large subunit-like protein  52.94 
 
 		 310 aa  199  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000537713  unclonable  0.00000275213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1736  hypothetical protein  42.8 
 
 		 303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2441  protein of unknown function DUF1376  35.95 
 
 		 253 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0517  primosomal protein DnaI  46.59 
 
 		 165 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582796 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04239  primosomal protein I  36.55 
 
 		 179 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000479477  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4902  primosomal protein DnaI  36.55 
 
 		 179 aa  79  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000841068  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04205  hypothetical protein  36.55 
 
 		 179 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4907  primosomal protein DnaI  36.55 
 
 		 179 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000108002  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3635  primosomal protein 1  36.55 
 
 		 179 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3693  primosomal protein DnaI  36.55 
 
 		 179 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000682768  hitchhiker  0.0041553 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4594  primosomal protein DnaI  36.55 
 
 		 179 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4955  primosomal protein DnaI  36.55 
 
 		 179 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5875  primosomal protein DnaI  36.55 
 
 		 179 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000199984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4899  primosomal protein DnaI  54.29 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.541302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4952  primosomal protein DnaI  54.29 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4798  primosomal protein DnaI  54.29 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.841736 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4865  primosomal protein DnaI  54.29 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4958  primosomal protein DnaI  54.29 
 
 		 179 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1059  hypothetical protein  34.29 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000696221  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1874  hypothetical protein  31.43 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0659  hypothetical protein  27.67 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1431  hypothetical protein  31.36 
 
 		 368 aa  53.1  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.464405  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1835  hypothetical protein  33.93 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116087 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1435  hypothetical protein  31.93 
 
 		 256 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2696  hypothetical protein  29.41 
 
 		 212 aa  47.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00490235  hitchhiker  0.000256672 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1130  hypothetical protein  29.81 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.3984  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8233  protein of unknown function DUF1376  44.44 
 
 		 202 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>