25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A4594 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A4594  primosomal protein DnaI  100 
 
 		 179 aa  364  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3635  primosomal protein 1  99.44 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151673  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04205  hypothetical protein  99.44 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000323192  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4902  primosomal protein DnaI  99.44 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000841068  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4907  primosomal protein DnaI  99.44 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000108002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4955  primosomal protein DnaI  99.44 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04239  primosomal protein I  99.44 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000479477  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3693  primosomal protein DnaI  98.88 
 
 		 179 aa  359  1e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000682768  hitchhiker  0.0041553 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5875  primosomal protein DnaI  98.88 
 
 		 179 aa  359  1e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000199984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4798  primosomal protein DnaI  81.56 
 
 		 179 aa  315  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.841736 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4865  primosomal protein DnaI  81.56 
 
 		 179 aa  315  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4958  primosomal protein DnaI  81.56 
 
 		 179 aa  315  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4899  primosomal protein DnaI  81.01 
 
 		 179 aa  314  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.541302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4952  primosomal protein DnaI  81.01 
 
 		 179 aa  314  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.997367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0517  primosomal protein DnaI  71.17 
 
 		 165 aa  251  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582796 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2209  hypothetical protein  54.79 
 
 		 347 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00285391  decreased coverage  5.0069399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1389  hypothetical protein  36.55 
 
 		 332 aa  79  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.16332e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1833  hypothetical protein  51.81 
 
 		 346 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000938078  decreased coverage  0.0000000000000142087 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3166  hypothetical protein  51.81 
 
 		 346 aa  78.6  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000168095  hitchhiker  1.83761e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1510  hypothetical protein  54.79 
 
 		 345 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.403027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2808  hypothetical protein  54.79 
 
 		 345 aa  77.4  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1756  hypothetical protein  50.6 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000208763  hitchhiker  0.000309878 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1161  hypothetical protein  50.6 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000610195  hitchhiker  1.74313e-19 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1424  hypothetical protein  50.6 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000647659  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2262  Pyocin large subunit-like protein  46.58 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000537713  unclonable  0.00000275213 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>