20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1059 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1059  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  620  1e-177  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000696221  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1431  hypothetical protein  98.57 
 
 
368 aa  270  1e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.464405  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1835  hypothetical protein  44.03 
 
 
286 aa  122  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116087 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1130  hypothetical protein  53.93 
 
 
310 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.3984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1435  hypothetical protein  55.06 
 
 
256 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0188  hypothetical protein  27.18 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2284  protein of unknown function DUF1376  32.77 
 
 
285 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492747  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4006  hypothetical protein  45.26 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464817  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3853  hypothetical protein  31.97 
 
 
268 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878224  hitchhiker  0.000000470201 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4689  hypothetical protein  37.5 
 
 
356 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.216675  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1736  hypothetical protein  38.2 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1389  hypothetical protein  34.29 
 
 
332 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  1.16332e-16 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0578  hypothetical protein  39.29 
 
 
270 aa  62.4  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.044729  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1758  hypothetical protein  53.12 
 
 
323 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3621  hypothetical protein  48.39 
 
 
283 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0768512  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1064  hypothetical protein  41.79 
 
 
164 aa  55.1  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1931  hypothetical protein  34.88 
 
 
258 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0476094  hitchhiker  0.0000000997177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2441  protein of unknown function DUF1376  32.26 
 
 
253 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  32.03 
 
 
243 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1336  hypothetical protein  32.18 
 
 
171 aa  43.5  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.513021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>