15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3621 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3621  hypothetical protein  100 
 
 
283 aa  570  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0768512  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4111  hypothetical protein  41.88 
 
 
301 aa  85.5  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000120566 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1510  hypothetical protein  29.89 
 
 
345 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.403027  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2808  hypothetical protein  30.68 
 
 
345 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2209  hypothetical protein  34.38 
 
 
347 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00285391  decreased coverage  5.0069399999999995e-21 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1059  hypothetical protein  48.39 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000696221  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1431  hypothetical protein  48.39 
 
 
368 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.464405  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4006  hypothetical protein  44.3 
 
 
293 aa  56.2  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.464817  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0188  hypothetical protein  39.08 
 
 
338 aa  55.5  0.0000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1931  hypothetical protein  34.44 
 
 
258 aa  53.1  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0476094  hitchhiker  0.0000000997177 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1064  hypothetical protein  36.05 
 
 
164 aa  52  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3853  hypothetical protein  39.44 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878224  hitchhiker  0.000000470201 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1758  hypothetical protein  44.26 
 
 
323 aa  46.6  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  34.34 
 
 
243 aa  46.2  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3007  hypothetical protein  24.44 
 
 
247 aa  45.8  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>