21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2284 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2284  protein of unknown function DUF1376  100 
 
 		 285 aa  592  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492747  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1389  hypothetical protein  69.59 
 
 		 332 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.16332e-16 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1736  hypothetical protein  61.54 
 
 		 303 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1083  gifsy-1 prophage PrpO  45.83 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00906063  hitchhiker  0.00000468495 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1053  gifsy-1 prophage PrpO  45.83 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0283915  hitchhiker  0.00000186889 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2284  gifsy-1 prophage PrpO  45.83 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0857509  normal  0.0949977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2834  replication protein O  42.2 
 
 		 294 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.119993  normal  0.314144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2441  protein of unknown function DUF1376  45.19 
 
 		 253 aa  85.5  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1059  hypothetical protein  32.77 
 
 		 295 aa  67  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000696221  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1874  hypothetical protein  32.59 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1303  C4-dicarboxylate transporter family protein, DctQ subunit  27.37 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.187485  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1431  hypothetical protein  32.48 
 
 		 368 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.464405  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0659  hypothetical protein  35.62 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1435  hypothetical protein  28.87 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1835  hypothetical protein  32 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1845  hypothetical protein  36.84 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.918053  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2696  hypothetical protein  31.58 
 
 		 212 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00490235  hitchhiker  0.000256672 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1130  hypothetical protein  30.77 
 
 		 310 aa  46.6  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.3984  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1033  gp60  33.82 
 
 		 311 aa  45.8  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1672  gp60  33.82 
 
 		 311 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0382632  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8233  protein of unknown function DUF1376  46.15 
 
 		 202 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>