More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1179 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1179  ISSod2, transposase OrfA  100 
 
 		 64 aa  135  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.353329  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2856  transposase IS3/IS911 family protein  67.19 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3450  transposase IS3/IS911 family protein  67.19 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000413069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3961  transposase IS3/IS911 family protein  67.19 
 
 		 88 aa  88.2  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0966  ISSod2, transposase OrfA  62.5 
 
 		 88 aa  84  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2161  ISSod2, transposase OrfA  62.5 
 
 		 88 aa  84  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4268  ISSod2, transposase OrfA  62.5 
 
 		 88 aa  84  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2975  transposase family protein  59.38 
 
 		 88 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385595  normal  0.0860166 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4024  transposase IS3/IS911 family protein  64.06 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3365  ISSod2, transposase OrfA  60.94 
 
 		 88 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2899  ISSod2, transposase OrfA  60.94 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3761  ISSod2, transposase OrfA  70.59 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 362 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  60.78 
 
 		 492 aa  72.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1803  transposase IS3/IS911 family protein  60.78 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3443  transposase IS3/IS911 family protein  51.56 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0079  IS407A, transposase OrfA  64.71 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0747988  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0636  IS3 family transposase  48.44 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.375793 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0639  IS3 family transposase  48.44 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.388667 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0850  IS3 family transposase  48.44 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4052  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0401  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1413  integrase catalytic subunit  62.22 
 
 		 399 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0240  transposase IS3/IS911 family protein  48.44 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945399 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3395  hypothetical protein  58.82 
 
 		 93 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.521621  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  56.86 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  56.86 
 
 		 88 aa  67  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2689  prophage LambdaMc01, ISMca4, transposase, OrfAB  51.56 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0539833  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  50.98 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  50.98 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  50.98 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  50.98 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  50.98 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3956  transposase IS3/IS911 family protein  52.54 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  50.98 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  50.98 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2579  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0712611  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6662  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00105508  hitchhiker  0.00193087 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  56.86 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1779  IS3 family transposase  45.31 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  54.9 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  47.17 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  47.17 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  47.17 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  47.17 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  54.9 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2193  transposase IS3/IS911 family protein  50.94 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1235  transposase IS3/IS911 family protein  50.94 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1288  transposase IS3/IS911 family protein  50.94 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02903  transposase ORF-A, IS-type  49.06 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6020  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1620  ISMca4, transposase, OrfAB  50 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0637  transposase IS3/IS911  49.06 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03180  hypothetical protein  51.67 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135  hitchhiker  0.00000000259634 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2601  transposase IS3/IS911 family protein  50.94 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  50 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  50 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0595  transposase IS3/IS911 family protein  58.82 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  50 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0036  transposase IS3/IS911 family protein  50.94 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0823  ISMca4, transposase, OrfAB  50 
 
 		 362 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586582  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  50.98 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  47.17 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0356  IS407A, transposase OrfA  45.31 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  50.98 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  50.98 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  50.98 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  47.17 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1078  hypothetical protein  47.17 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2763  transposase IS3/IS911 family protein  50.98 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.577864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  48.08 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  48.08 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  48.08 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  48.08 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1093  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1610  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 97 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1457  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2513  hypothetical protein  50 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3341  hypothetical protein  49.06 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55070  hypothetical protein  58.14 
 
 		 87 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760769  unclonable  1.2837699999999998e-21 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  47.17 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  47.17 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  47.17 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  47.17 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0557  ISRSO16-transposase OrfA protein  50.94 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.235174 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2623  transposase IS3/IS911  50.98 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal  0.218597 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3222  transposase IS3/IS911  50.98 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.170867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3527  transposase IS3/IS911  50.98 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117396 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3727  transposase IS3/IS911  50.98 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4851  transposase IS3/IS911 family protein  50.98 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0283322 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  48.08 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3628  transposase IS3/IS911 family protein  58 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00241648  normal  0.128538 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2982  transposase IS3/IS911 family protein  46.94 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.439575  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  47.06 
 
 		 393 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3395  transposase IS3/IS911 family protein  50.98 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2896  transposase  46.94 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000661086  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0317  transposase  46.94 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457951  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>