110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0310 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0310  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  116  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0036  IS629, transposase orfA  94.29 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0077  putative transposase family protein  94.29 
 
 		 167 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.302219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1304  IS629, transposase orfA  94.29 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1380  IS629, transposase orfA  94.29 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0740626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2491  IS629, transposase orfA  94.29 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.99232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2666  IS629, transposase orfA  94.29 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331331 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2679  IS629, transposase orfA  94.29 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0539496  normal  0.023589 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0101  IS629 transposase orfA  91.43 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0789962  hitchhiker  0.0000515378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2259  IS629 transposase orfA  94.29 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4790  IS1203 transposase orfA  91.43 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.336245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0989  IS629 transposase orfA  91.43 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1591  IS629 transposase orfA  91.43 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1923  IS629 transposase orfA  91.43 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.968111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4643  IS629 transposase orfA  91.43 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4764  IS1203 transposase orfA  91.43 
 
 		 108 aa  71.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0288  transposase subfamily  91.43 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.07567e-42  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1239  IS1203 transposase orfA  91.43 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1665  IS1203 transposase orfA  91.43 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0060  IS629 transposase orfA  91.43 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0080  IS1203 transposase orfA  91.43 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000633207  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0133  IS629 transposase orfA  91.43 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.743036  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0207  IS629 transposase orfA  91.43 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0220  IS629 transposase orfA  91.43 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0246  IS629 transposase orfA  91.43 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0296  IS629 transposase orfA  91.43 
 
 		 108 aa  70.1  0.000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000121277  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0053  IS629, transposase orfA  91.43 
 
 		 108 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0027  IS629, transposase orfA  88.57 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116666  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4772  IS1203 transposase orfA  88.57 
 
 		 113 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371432  normal  0.791155 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0042  IS629, transposase orfA  88.57 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0292  IS629, transposase orfA  88.57 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.642874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1169  IS629, transposase orfA  88.57 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.481035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1177  IS629, transposase orfA  88.57 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1656  IS629, transposase orfA  88.57 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2285  IS629, transposase orfA  88.57 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.113607  hitchhiker  0.00000000000000192514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2788  IS629, transposase orfA  88.57 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.253032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2844  IS629, transposase orfA  88.57 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.865071 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2933  IS629, transposase orfA  88.57 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  hitchhiker  0.0000000000000376997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3231  IS629, transposase orfA  88.57 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172275  hitchhiker  0.000705402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3385  IS629, transposase orfA  88.57 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3515  IS629, transposase orfA  88.57 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0406871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3873  IS629, transposase orfA  88.57 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.997702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4590  IS629, transposase orfA  88.57 
 
 		 108 aa  68.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0014  IS629, transposase orfA  88.57 
 
 		 108 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4843  IS629, transposase orfA  88.57 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0038  hypothetical protein  70.59 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3905  transposase IS3/IS911 family protein  55.77 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  0.925618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  68.57 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3254  transposase IS3/IS911 family protein  55.77 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5123  transposase IS3/IS911  57.78 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5203  transposase IS3/IS911  57.78 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1861  hypothetical protein  55.56 
 
 		 239 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  55.56 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0739  transposase IS3/IS911 family protein  64.86 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0235806  normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  64.86 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  64.86 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6733  transposase IS3/IS911 family protein  75.86 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.975909  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0009  transposase IS3/IS911 family protein  64.86 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  64.86 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1895  ISMca3, transposase, OrfA  60 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.827912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  53.33 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  53.33 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3845  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9013  normal  0.358266 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4706  transposase IS3/IS911 family protein  63.89 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1427  transposase IS3/IS911 family protein  58.82 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.199874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1610  ISAfe7, transposase orfA  58.82 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.20784  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3161  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.465896  normal  0.307305 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6427  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.906991 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6464  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2976  Tn4652, transposase subunit A  48.89 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57447  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1596  transposase IS3 family protein  58.82 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.438751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1635  transposase IS3 family protein  58.82 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169974  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1752  transposase IS3 family protein  58.82 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.220744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2514  transposase IS3 family protein  58.82 
 
 		 107 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.412806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3547  transposase IS3/IS911 family protein  63.89 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7787  transposase IS3/IS911 family protein  69.44 
 
 		 108 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00188003  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3706  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3737  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9899  hypothetical protein  56.76 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9837  transposase protein  56.76 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1617  transposase IS3/IS911 family protein  55.88 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3562  transposase IS3/IS911 family protein  55.88 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107559  normal  0.12566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10853  transposase  60.71 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.71857e-46  hitchhiker  0.0000000080045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11347  transposase  60.71 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.3772600000000003e-34  normal  0.888349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11740  transposase  60.71 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.53193e-56  normal  0.308652 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11774  transposase  60.71 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.9098299999999996e-43  hitchhiker  0.00000000075724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11781  transposase  60.71 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.66965e-85  hitchhiker  0.000000000569119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11784  transposase  60.71 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.00725e-90  hitchhiker  0.0000000133913 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11791  transposase  60.71 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  7.324620000000001e-61  hitchhiker  0.00000385538 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11807  transposase  60.71 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.601339999999999e-45  hitchhiker  0.00672447 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12049  transposase  60.71 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.40799e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12113  transposase  60.71 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.72555e-57  normal  0.924844 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12377  transposase  60.71 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.02474e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12380  transposase  60.71 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.5215000000000001e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12417  transposase  60.71 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.85202e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12829  transposase  60.71 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.40646e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13131  transposase  60.71 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000102607  normal  0.123533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13207  transposase  60.71 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.838360000000001e-28  normal  0.797381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13358  transposase  60.71 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.49743e-39  normal  0.534479 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4952  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 		 108 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>