62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_D0038 on replicon NC_009788
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009788  EcE24377A_D0038  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  231  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0042  IS629, transposase orfA  78.79 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0292  IS629, transposase orfA  78.79 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.642874 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1169  IS629, transposase orfA  78.79 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.481035 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1177  IS629, transposase orfA  78.79 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1656  IS629, transposase orfA  78.79 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000517206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0027  IS629, transposase orfA  78.79 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.116666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2788  IS629, transposase orfA  78.79 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.253032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2844  IS629, transposase orfA  78.79 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.865071 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2285  IS629, transposase orfA  78.79 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.113607  hitchhiker  0.00000000000000192514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2933  IS629, transposase orfA  78.79 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  hitchhiker  0.0000000000000376997 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3231  IS629, transposase orfA  78.79 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.172275  hitchhiker  0.000705402 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3385  IS629, transposase orfA  78.79 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3515  IS629, transposase orfA  78.79 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0406871 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3873  IS629, transposase orfA  78.79 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.997702 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4590  IS629, transposase orfA  78.79 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4772  IS1203 transposase orfA  78.79 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.371432  normal  0.791155 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0053  IS629, transposase orfA  75.76 
 
 		 108 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.214082  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0014  IS629, transposase orfA  78.79 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4764  IS1203 transposase orfA  75.76 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4643  IS629 transposase orfA  75.76 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1923  IS629 transposase orfA  75.76 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.968111  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1591  IS629 transposase orfA  75.76 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0101  IS629 transposase orfA  75.76 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0789962  hitchhiker  0.0000515378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4790  IS1203 transposase orfA  75.76 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.336245 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0989  IS629 transposase orfA  75.76 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2491  IS629, transposase orfA  72.73 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.99232 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4843  IS629, transposase orfA  72.73 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1380  IS629, transposase orfA  72.73 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0740626 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1304  IS629, transposase orfA  72.73 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.679412 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2259  IS629 transposase orfA  72.73 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0036  IS629, transposase orfA  72.73 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2666  IS629, transposase orfA  72.73 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000331331 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2679  IS629, transposase orfA  72.73 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0539496  normal  0.023589 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0288  transposase subfamily  67.57 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.07567e-42  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1239  IS1203 transposase orfA  72.73 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.872815  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0310  hypothetical protein  70.59 
 
 		 55 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0296  IS629 transposase orfA  72.73 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000121277  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0246  IS629 transposase orfA  72.73 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0077  putative transposase family protein  67.57 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.302219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0220  IS629 transposase orfA  72.73 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0207  IS629 transposase orfA  72.73 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0133  IS629 transposase orfA  72.73 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.743036  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0080  IS1203 transposase orfA  72.73 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000633207  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0060  IS629 transposase orfA  72.73 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1665  IS1203 transposase orfA  72.73 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0906  transposase IS3/IS911 family protein  56.76 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2819  transposase IS3/IS911 family protein  54.05 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1861  hypothetical protein  54.05 
 
 		 239 aa  45.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1140  transposase IS3/IS911 family protein  42.62 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.816485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3254  transposase IS3/IS911 family protein  51.35 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5203  transposase IS3/IS911  51.35 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.296974  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5123  transposase IS3/IS911  51.35 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1895  ISMca3, transposase, OrfA  51.35 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.827912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3905  transposase IS3/IS911 family protein  48.65 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.86052  normal  0.925618 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2936  transposase IS3/IS911 family protein  48.65 
 
 		 107 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.312037  normal  0.721078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2976  Tn4652, transposase subunit A  48.65 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.57447  normal  0.0864617 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1827  transposase IS3/IS911 family protein  48.72 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.601714  normal  0.0105174 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0009  transposase IS3/IS911 family protein  48.72 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5542  transposase DNA binding site ISRme15  48.72 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6068  transposase DNA binding site ISRme15  48.72 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.382564 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0739  transposase IS3/IS911 family protein  48.72 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0235806  normal  0.101516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>