44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0114 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0114  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  875    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.715385  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1100  putative receptor  29.41 
 
 		 352 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3495  putative receptor  27.57 
 
 		 356 aa  117  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1704  hypothetical protein  28.44 
 
 		 353 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.188458  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1765  hypothetical protein  27.91 
 
 		 353 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.905763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1057  putative periplasmic protein  29.32 
 
 		 361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00889034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1755  hypothetical protein  27.61 
 
 		 353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0322938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1574  putative periplasmic protein  27.61 
 
 		 353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000189121  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1701  hypothetical protein  27.61 
 
 		 353 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.117434  normal  0.828136 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0586  putative receptor  26.3 
 
 		 358 aa  107  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5134  hypothetical protein  25.63 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0254476  normal  0.895353 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01420  hypothetical protein  26.48 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1724  hypothetical protein  26.48 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2207  putative receptor  26.48 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0362062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1634  hypothetical protein  26.48 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.679597  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01409  hypothetical protein  26.48 
 
 		 353 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.167472  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1719  hypothetical protein  26.17 
 
 		 353 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023319 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2058  hypothetical protein  26.48 
 
 		 353 aa  100  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.132417  hitchhiker  0.00041859 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2194  putative receptor  25.86 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000873978  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1539  hypothetical protein  25.86 
 
 		 353 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0381  hypothetical protein  24.39 
 
 		 381 aa  94.7  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.71003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2098  hypothetical protein  24.31 
 
 		 353 aa  93.6  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0059068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.08 
 
 		 752 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  23.9 
 
 		 1667 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6217  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  28.93 
 
 		 829 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2207  hypothetical protein  32.53 
 
 		 305 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0353672  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  33.73 
 
 		 333 aa  51.6  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3065  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.09 
 
 		 356 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  20.98 
 
 		 366 aa  49.7  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1940  hypothetical protein  25.08 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.728098  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  24.14 
 
 		 332 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2955  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.13 
 
 		 818 aa  47  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0137484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  27.93 
 
 		 776 aa  46.6  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0979  hypothetical protein  19.64 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5012  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  21.9 
 
 		 328 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3892  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.08 
 
 		 660 aa  45.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1627  hypothetical protein  28.57 
 
 		 451 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.23 
 
 		 320 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8029  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.36 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.882346  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.17 
 
 		 517 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.41 
 
 		 953 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000882401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1627  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  30.86 
 
 		 335 aa  44.3  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0205885  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  26.8 
 
 		 250 aa  43.1  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.93 
 
 		 314 aa  43.1  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>