28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2466 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
320 aa  635    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2536  hypothetical protein  34.98 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000813757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2196  hypothetical protein  34.85 
 
 
366 aa  89.4  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2159  hypothetical protein  33.84 
 
 
360 aa  89  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2474  hypothetical protein  34.85 
 
 
356 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.905992  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3630  hypothetical protein  32.45 
 
 
316 aa  85.9  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.235795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4087  hypothetical protein  30.57 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.354046 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4455  hypothetical protein  31.03 
 
 
326 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.687506  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3916  hypothetical protein  32.21 
 
 
347 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0784  hypothetical protein  27.7 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6988  hypothetical protein  28 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3192  hypothetical protein  33.33 
 
 
272 aa  76.3  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3500  hypothetical protein  27.35 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  0.117636 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2055  hypothetical protein  30.53 
 
 
315 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1526  hypothetical protein  31.25 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1495  hypothetical protein  31.25 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1630  PAP2 family protein  31.25 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0585  hypothetical protein  31.25 
 
 
357 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0790  PAP2 family protein  31.25 
 
 
357 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.711011  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0567  PAP2 family protein  31.25 
 
 
357 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.738969  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1303  hypothetical protein  31.25 
 
 
357 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2761  PAP2 family protein  29.52 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0475129  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4568  hypothetical protein  30.33 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3305  hypothetical protein  26.15 
 
 
315 aa  67  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0440938  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4083  hypothetical protein  29.15 
 
 
341 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.235358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4894  hypothetical protein  31.51 
 
 
355 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  hitchhiker  0.00422795 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2652  hypothetical protein  29.53 
 
 
319 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.442559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4542  hypothetical protein  26.84 
 
 
421 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00650799  normal  0.54265 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>