27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3916 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3916  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  647    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2196  hypothetical protein  55.14 
 
 		 366 aa  272  7e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2474  hypothetical protein  54.45 
 
 		 356 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.905992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2159  hypothetical protein  55.14 
 
 		 360 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4894  hypothetical protein  61.15 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  hitchhiker  0.00422795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3630  hypothetical protein  37.87 
 
 		 316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.235795 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0784  hypothetical protein  31.91 
 
 		 317 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2761  PAP2 family protein  37.39 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0475129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3192  hypothetical protein  36.06 
 
 		 272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2055  hypothetical protein  33.01 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4083  hypothetical protein  36.17 
 
 		 341 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.235358 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1303  hypothetical protein  36.87 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0567  PAP2 family protein  36.87 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.738969  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1495  hypothetical protein  36.87 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265747  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1526  hypothetical protein  36.87 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0585  hypothetical protein  36.87 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1630  PAP2 family protein  36.87 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0790  PAP2 family protein  36.87 
 
 		 357 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.711011  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2652  hypothetical protein  31.21 
 
 		 319 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.442559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6988  hypothetical protein  34.55 
 
 		 357 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2536  hypothetical protein  31 
 
 		 316 aa  95.1  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000813757 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.21 
 
 		 320 aa  90.5  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3500  hypothetical protein  29.82 
 
 		 333 aa  87.8  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  0.117636 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3305  hypothetical protein  27.96 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0440938  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4455  hypothetical protein  32.99 
 
 		 326 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.687506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4087  hypothetical protein  32.49 
 
 		 326 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.354046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4568  hypothetical protein  31.31 
 
 		 326 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>