29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2159 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2159  hypothetical protein  100 
 
 
360 aa  684    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2474  hypothetical protein  79.17 
 
 
356 aa  525  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.905992  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2196  hypothetical protein  79.44 
 
 
366 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4894  hypothetical protein  62.54 
 
 
355 aa  286  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  hitchhiker  0.00422795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3916  hypothetical protein  54.52 
 
 
347 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3630  hypothetical protein  35.51 
 
 
316 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.235795 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0784  hypothetical protein  32.36 
 
 
317 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2761  PAP2 family protein  34.78 
 
 
357 aa  122  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0475129  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2536  hypothetical protein  31.68 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000813757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2652  hypothetical protein  31.23 
 
 
319 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.442559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4083  hypothetical protein  38.6 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.235358 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3500  hypothetical protein  28.82 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  0.117636 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2055  hypothetical protein  30.41 
 
 
315 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3192  hypothetical protein  32.77 
 
 
272 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1303  hypothetical protein  33.33 
 
 
357 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0567  PAP2 family protein  33.33 
 
 
357 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.738969  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0790  PAP2 family protein  33.33 
 
 
357 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.711011  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0585  hypothetical protein  33.33 
 
 
357 aa  106  6e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1526  hypothetical protein  33.33 
 
 
357 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1495  hypothetical protein  33.09 
 
 
357 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1630  PAP2 family protein  33.33 
 
 
357 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6988  hypothetical protein  34.85 
 
 
357 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4455  hypothetical protein  32.85 
 
 
326 aa  101  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.687506  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4087  hypothetical protein  32.12 
 
 
326 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.354046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.84 
 
 
320 aa  89.4  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3305  hypothetical protein  28.62 
 
 
315 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0440938  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4568  hypothetical protein  29.82 
 
 
326 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2690  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.68 
 
 
166 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.448983  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3724  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.87 
 
 
285 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>