30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4083 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4083  hypothetical protein  100 
 
 
341 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.235358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2055  hypothetical protein  52.61 
 
 
315 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2761  PAP2 family protein  44.93 
 
 
357 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0475129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3192  hypothetical protein  43.9 
 
 
272 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1526  hypothetical protein  47.37 
 
 
357 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1495  hypothetical protein  47.37 
 
 
357 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1630  PAP2 family protein  47.37 
 
 
357 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0790  PAP2 family protein  47.37 
 
 
357 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.711011  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0585  hypothetical protein  47.37 
 
 
357 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0567  PAP2 family protein  47.37 
 
 
357 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.738969  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1303  hypothetical protein  47.37 
 
 
357 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2652  hypothetical protein  40.45 
 
 
319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.442559  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0784  hypothetical protein  37.95 
 
 
317 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2536  hypothetical protein  37.56 
 
 
316 aa  145  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000813757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3500  hypothetical protein  33.64 
 
 
333 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  0.117636 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2159  hypothetical protein  38.6 
 
 
360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2474  hypothetical protein  37.67 
 
 
356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.905992  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2196  hypothetical protein  37.67 
 
 
366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3916  hypothetical protein  36.17 
 
 
347 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3630  hypothetical protein  32.72 
 
 
316 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.235795 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6988  hypothetical protein  33.67 
 
 
357 aa  94  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4894  hypothetical protein  34.8 
 
 
355 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  hitchhiker  0.00422795 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3305  hypothetical protein  26.77 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0440938  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.15 
 
 
320 aa  70.1  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4087  hypothetical protein  27.35 
 
 
326 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.354046 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4455  hypothetical protein  27.24 
 
 
326 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.687506  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4568  hypothetical protein  28.25 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1552  hypothetical protein  23.5 
 
 
296 aa  50.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1431  hypothetical protein  23.5 
 
 
291 aa  49.7  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3202  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.66 
 
 
293 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>