27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2055 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2055  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  628  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4083  hypothetical protein  53.42 
 
 		 341 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.235358 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2761  PAP2 family protein  43.88 
 
 		 357 aa  209  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0475129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3192  hypothetical protein  43.73 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1495  hypothetical protein  43.23 
 
 		 357 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1630  PAP2 family protein  43.18 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1526  hypothetical protein  43.18 
 
 		 357 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0790  PAP2 family protein  43.18 
 
 		 357 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.711011  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0585  hypothetical protein  43.18 
 
 		 357 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1303  hypothetical protein  43.18 
 
 		 357 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0567  PAP2 family protein  43.18 
 
 		 357 aa  188  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.738969  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2652  hypothetical protein  37.38 
 
 		 319 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.442559  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0784  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2536  hypothetical protein  32.54 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000813757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3916  hypothetical protein  36.96 
 
 		 347 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3630  hypothetical protein  28.11 
 
 		 316 aa  102  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.235795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2159  hypothetical protein  30.21 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2196  hypothetical protein  29.74 
 
 		 366 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3500  hypothetical protein  27.08 
 
 		 333 aa  96.7  5e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  0.117636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2474  hypothetical protein  29.74 
 
 		 356 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.905992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6988  hypothetical protein  29.95 
 
 		 357 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4087  hypothetical protein  33.16 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.354046 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4455  hypothetical protein  30.97 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.687506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3305  hypothetical protein  27.62 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0440938  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.53 
 
 		 320 aa  73.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4568  hypothetical protein  29.44 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4894  hypothetical protein  31.55 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  hitchhiker  0.00422795 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>