29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2652 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2652  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  623  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.442559  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2761  PAP2 family protein  42.52 
 
 
357 aa  198  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0475129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1630  PAP2 family protein  42.97 
 
 
357 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1526  hypothetical protein  42.97 
 
 
357 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1495  hypothetical protein  42.8 
 
 
357 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265747  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0790  PAP2 family protein  42.97 
 
 
357 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.711011  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0585  hypothetical protein  42.97 
 
 
357 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0567  PAP2 family protein  42.97 
 
 
357 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.738969  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1303  hypothetical protein  42.97 
 
 
357 aa  190  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4083  hypothetical protein  42.08 
 
 
341 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.235358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2055  hypothetical protein  37.38 
 
 
315 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0784  hypothetical protein  37.09 
 
 
317 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3192  hypothetical protein  38.58 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2536  hypothetical protein  36.15 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000813757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3500  hypothetical protein  33.77 
 
 
333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  0.117636 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3630  hypothetical protein  29.43 
 
 
316 aa  119  9e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.235795 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2159  hypothetical protein  31.23 
 
 
360 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2196  hypothetical protein  31.93 
 
 
366 aa  103  6e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2474  hypothetical protein  31.58 
 
 
356 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.905992  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3305  hypothetical protein  30.22 
 
 
315 aa  92  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0440938  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3916  hypothetical protein  32.75 
 
 
347 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4894  hypothetical protein  34.03 
 
 
355 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  hitchhiker  0.00422795 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4455  hypothetical protein  30.45 
 
 
326 aa  87  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.687506  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6988  hypothetical protein  32.84 
 
 
357 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4087  hypothetical protein  29.63 
 
 
326 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.354046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4568  hypothetical protein  30.46 
 
 
326 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1431  hypothetical protein  24.35 
 
 
291 aa  62.4  0.000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1552  hypothetical protein  23.91 
 
 
296 aa  62.4  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.53 
 
 
320 aa  60.5  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>