28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2196 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2196  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  698    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2474  hypothetical protein  98.03 
 
 		 356 aa  665    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.905992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2159  hypothetical protein  79.44 
 
 		 360 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4894  hypothetical protein  64.31 
 
 		 355 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  hitchhiker  0.00422795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3916  hypothetical protein  55.14 
 
 		 347 aa  239  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3630  hypothetical protein  34.07 
 
 		 316 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.235795 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2761  PAP2 family protein  34.37 
 
 		 357 aa  122  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0475129  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3500  hypothetical protein  30.07 
 
 		 333 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  0.117636 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0784  hypothetical protein  31.16 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2536  hypothetical protein  31.4 
 
 		 316 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000813757 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1495  hypothetical protein  33.82 
 
 		 357 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1303  hypothetical protein  33.7 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0567  PAP2 family protein  33.7 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.738969  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0585  hypothetical protein  33.7 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0790  PAP2 family protein  33.7 
 
 		 357 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.711011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1526  hypothetical protein  33.7 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1630  PAP2 family protein  33.7 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3192  hypothetical protein  34.86 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4083  hypothetical protein  37.67 
 
 		 341 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.235358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2652  hypothetical protein  31.93 
 
 		 319 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.442559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6988  hypothetical protein  34.34 
 
 		 357 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2055  hypothetical protein  29.74 
 
 		 315 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4455  hypothetical protein  32.64 
 
 		 326 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.687506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3305  hypothetical protein  29.14 
 
 		 315 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0440938  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.85 
 
 		 320 aa  89.4  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4087  hypothetical protein  32 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.354046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4568  hypothetical protein  29.18 
 
 		 326 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2690  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.46 
 
 		 166 aa  42.7  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.448983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>