29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0784 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0784  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  622  1e-177  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2536  hypothetical protein  68.81 
 
 		 316 aa  401  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000813757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2652  hypothetical protein  37.09 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.442559  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3192  hypothetical protein  39.17 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2761  PAP2 family protein  36.48 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0475129  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2055  hypothetical protein  33.33 
 
 		 315 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1526  hypothetical protein  42.02 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1630  PAP2 family protein  42.02 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1495  hypothetical protein  42.02 
 
 		 357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265747  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0790  PAP2 family protein  42.02 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.711011  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0585  hypothetical protein  42.02 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0567  PAP2 family protein  42.02 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.738969  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1303  hypothetical protein  42.02 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4083  hypothetical protein  37.95 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.235358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3630  hypothetical protein  34.18 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.235795 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3500  hypothetical protein  37.26 
 
 		 333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  0.117636 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2159  hypothetical protein  32.53 
 
 		 360 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2196  hypothetical protein  31.16 
 
 		 366 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2474  hypothetical protein  31.51 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.905992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3916  hypothetical protein  33.2 
 
 		 347 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4894  hypothetical protein  31.23 
 
 		 355 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  hitchhiker  0.00422795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4087  hypothetical protein  32.3 
 
 		 326 aa  94  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.354046 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4455  hypothetical protein  32.41 
 
 		 326 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.687506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6988  hypothetical protein  30.8 
 
 		 357 aa  87.4  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3305  hypothetical protein  32.02 
 
 		 315 aa  86.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0440938  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.7 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4568  hypothetical protein  28.78 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1431  hypothetical protein  24.17 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1552  hypothetical protein  22.58 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>