29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0585 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0790  PAP2 family protein  100 
 
 
357 aa  687    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.711011  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0585  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  687    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1526  hypothetical protein  99.16 
 
 
357 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1495  hypothetical protein  98.88 
 
 
357 aa  677    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265747  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0567  PAP2 family protein  100 
 
 
357 aa  687    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.738969  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1303  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  687    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1630  PAP2 family protein  99.16 
 
 
357 aa  679    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2761  PAP2 family protein  80.39 
 
 
357 aa  471  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0475129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3192  hypothetical protein  45.97 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14841  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2055  hypothetical protein  42.39 
 
 
315 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4083  hypothetical protein  42.3 
 
 
341 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141782  normal  0.235358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2652  hypothetical protein  42.28 
 
 
319 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.442559  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0784  hypothetical protein  38.18 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2536  hypothetical protein  37.63 
 
 
316 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000813757 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2474  hypothetical protein  34.93 
 
 
356 aa  136  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.905992  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2196  hypothetical protein  34.25 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3630  hypothetical protein  35 
 
 
316 aa  124  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.235795 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3500  hypothetical protein  32.28 
 
 
333 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal  0.117636 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2159  hypothetical protein  32.48 
 
 
360 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3916  hypothetical protein  37.33 
 
 
347 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6988  hypothetical protein  34.45 
 
 
357 aa  92.8  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4894  hypothetical protein  33.33 
 
 
355 aa  87  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105451  hitchhiker  0.00422795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4087  hypothetical protein  32.48 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.138536  normal  0.354046 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4455  hypothetical protein  31.4 
 
 
326 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.687506  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3305  hypothetical protein  24.46 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0440938  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.12 
 
 
320 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1431  hypothetical protein  25.79 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1552  hypothetical protein  26.24 
 
 
296 aa  65.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4568  hypothetical protein  30 
 
 
326 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>